22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1025 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1025  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  447  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0256  hypothetical protein  50.71 
 
 
226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0420  hypothetical protein  41.52 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3218  AroM family protein  41.52 
 
 
225 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0458  hypothetical protein  41.52 
 
 
225 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0417  hypothetical protein  41.52 
 
 
225 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0307  hypothetical protein  41.52 
 
 
225 aa  196  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0464  hypothetical protein  41.07 
 
 
225 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00341  hypothetical protein  41.07 
 
 
225 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3242  hypothetical protein  41.07 
 
 
225 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32853  normal  0.0411186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00337  hypothetical protein  41.07 
 
 
225 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0861  hypothetical protein  43.3 
 
 
225 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.37011  normal  0.40333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0433  hypothetical protein  40.62 
 
 
225 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0428  hypothetical protein  40.62 
 
 
225 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.855339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0427  hypothetical protein  40.62 
 
 
225 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0446  hypothetical protein  40.62 
 
 
225 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.278039  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0488  hypothetical protein  40.62 
 
 
225 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2685  AroM family protein  36.44 
 
 
227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.864321  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0212  hypothetical protein  36 
 
 
223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4170  AroM family protein  37.55 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000209007  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1827  hypothetical protein  29.55 
 
 
223 aa  95.1  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.988892  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1686  AroM family protein  36.28 
 
 
235 aa  95.1  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0341417  normal  0.432359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>