66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1005 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1005  cobalt transport protein  100 
 
 
229 aa  450  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0095  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.4 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0325  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.36 
 
 
255 aa  86.3  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2603  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.8 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25508  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1191  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.62 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0184  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  27.98 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0187  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  27.98 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1220  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  30.09 
 
 
264 aa  82  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3207  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  27.65 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0727  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.79 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197575  normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3734  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.18 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0430563  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0714  cobalt transport protein  29.74 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0144  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.183976  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1704  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.2 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1859  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.58 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1383  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.33 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1224  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.17 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00358122  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0529  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.58 
 
 
258 aa  72  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2331  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.9 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3658  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.83 
 
 
242 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.411896  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3822  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.05 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1268  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.09 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1547  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.78 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000302201  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1295  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  21.67 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0707234  normal  0.0195569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  41.98 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1062  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.56 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.104457  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1698  cobalt ABC transporter CbiQ, inner membrane subunit  25.59 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000031286  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0562  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.89 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2733  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.81 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4180  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.17 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0578  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.36 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.852275  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  27.19 
 
 
599 aa  63.5  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0929  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.44 
 
 
244 aa  62  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0576637  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0792  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.19 
 
 
254 aa  61.6  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2148  cobalt transport protein  39.53 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1218  cobalt ABC transporter, permease protein  28.21 
 
 
260 aa  59.7  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2791  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.6 
 
 
247 aa  58.9  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295927  decreased coverage  0.000165031 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2197  cobalt ABC transporter permease protein CbiQ  24.62 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2243  cobalt ABC transporter permease CbiQ  24.62 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.142646 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2190  cobalt ABC transporter permease CbiQ  24.62 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.757374  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2143  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  24.62 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3591  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  19.3 
 
 
255 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2356  cobalt ABC transporter permease CbiQ  24.1 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.208194 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0474  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  31.58 
 
 
250 aa  56.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1757  cobalt transport protein  25.48 
 
 
266 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2618  cobalt transport protein  25.44 
 
 
242 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1183  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.88 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.239886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1695  cobalt transport protein  31.4 
 
 
246 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.96 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000100413  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3002  cobalt ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3890  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  34.88 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1707  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.92 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.72 
 
 
254 aa  52  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0134  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.12 
 
 
255 aa  49.3  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.298184  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0541  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.06 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.906883  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1102  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.58 
 
 
270 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1862  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  26.14 
 
 
314 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.144825  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0088  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.27 
 
 
258 aa  46.6  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2593  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  21.23 
 
 
255 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.08926  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2761  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.39 
 
 
270 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4721  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.32 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0190  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  34.62 
 
 
271 aa  43.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000816865  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1769  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.03 
 
 
256 aa  42  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.344315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2440  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  28.1 
 
 
270 aa  42  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0883  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.24 
 
 
279 aa  41.6  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1199  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  21.63 
 
 
270 aa  41.6  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00978481  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>