70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2356 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2356  cobalt ABC transporter permease CbiQ  100 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.208194 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2197  cobalt ABC transporter permease protein CbiQ  98.22 
 
 		 225 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2143  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  98.67 
 
 		 225 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2190  cobalt ABC transporter permease CbiQ  98.67 
 
 		 225 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.757374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2243  cobalt ABC transporter permease CbiQ  98.67 
 
 		 225 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.142646 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1707  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.48 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2603  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.49 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1220  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  31.42 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0184  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  27.19 
 
 		 256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0187  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  26.75 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3734  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.09 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0430563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0325  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.28 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1268  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.79 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1859  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.78 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1062  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.88 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.104457  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0095  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.09 
 
 		 257 aa  85.9  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0727  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.44 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197575  normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0144  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.39 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.183976  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1191  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.66 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2733  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.96 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.55 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3822  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.54 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1698  cobalt ABC transporter CbiQ, inner membrane subunit  25.68 
 
 		 260 aa  78.2  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000031286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1218  cobalt ABC transporter, permease protein  24.2 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2331  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.92 
 
 		 263 aa  75.1  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0578  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.79 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.852275  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2791  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.23 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295927  decreased coverage  0.000165031 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1383  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.94 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0562  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.63 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0529  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.07 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2148  cobalt transport protein  24.89 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4721  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.44 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1295  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.21 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0707234  normal  0.0195569 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  24.78 
 
 		 599 aa  68.6  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1704  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.58 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2593  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.15 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.08926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3658  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.11 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.411896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3591  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.51 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0792  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.31 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1757  cobalt transport protein  31.82 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1224  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.48 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00358122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.24 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3890  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.24 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4180  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.68 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3207  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  21.17 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0541  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.27 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.906883  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3002  cobalt ABC transporter, permease protein  36.26 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0474  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  33.7 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0929  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.05 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0576637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1547  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  21.4 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000302201  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1005  cobalt transport protein  24.1 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2440  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  25.62 
 
 		 270 aa  52.4  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.32 
 
 		 270 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000100413  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0491  cobalt transport protein  23.74 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.641356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0170  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.79 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1802  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.17 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113984  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0714  cobalt transport protein  30.84 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2761  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.72 
 
 		 270 aa  48.9  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2020  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.82 
 
 		 252 aa  48.9  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000160433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2618  cobalt transport protein  23.47 
 
 		 242 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1102  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.11 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.52 
 
 		 265 aa  45.8  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.916365  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1280  cobalt ABC transporter, permease protein  27.47 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15388  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0485  cobalt transport protein  23.57 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2003  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.97 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.1214e-25 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1192  cobalt ABC transporter, permease protein, putative  26.32 
 
 		 254 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00889776  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2006  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.19 
 
 		 251 aa  42  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0118677  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1765  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.73 
 
 		 267 aa  42  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00054388  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1754  cobalt transport protein  33.64 
 
 		 216 aa  41.6  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0819489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1183  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25 
 
 		 265 aa  41.6  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.239886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>