71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3658 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010815  Glov_3658  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  100 
 
 		 242 aa  480  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.411896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1224  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  45.97 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00358122  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1695  cobalt transport protein  46.53 
 
 		 246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1220  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  37.21 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3734  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.35 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0430563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0325  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.33 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0144  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.73 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.183976  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3207  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  29.22 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0095  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.51 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1191  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.49 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0929  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  37.07 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0576637  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1859  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.69 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0184  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  28.25 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0187  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  28.25 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2791  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  34.76 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295927  decreased coverage  0.000165031 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1383  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.44 
 
 		 299 aa  102  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0727  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.86 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197575  normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0541  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  35.05 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.906883  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2593  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  36.22 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.08926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0578  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.63 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.852275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1218  cobalt ABC transporter, permease protein  30.5 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2603  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.79 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25508  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0529  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.28 
 
 		 258 aa  95.1  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.73 
 
 		 257 aa  91.7  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1295  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.18 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0707234  normal  0.0195569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2148  cobalt transport protein  27.6 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0792  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.6 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1704  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.24 
 
 		 262 aa  89.4  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1698  cobalt ABC transporter CbiQ, inner membrane subunit  30.05 
 
 		 260 aa  89.4  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000031286  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0562  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.08 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1547  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.57 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000302201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4721  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.23 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2733  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.82 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1268  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.31 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3591  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.28 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2331  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.2 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1062  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  37.5 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.104457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1757  cobalt transport protein  30.77 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1707  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.23 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2618  cobalt transport protein  29.95 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3822  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.07 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  23.98 
 
 		 599 aa  71.6  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1005  cobalt transport protein  27.83 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0714  cobalt transport protein  25.1 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2243  cobalt ABC transporter permease CbiQ  25.11 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.142646 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2356  cobalt ABC transporter permease CbiQ  25.11 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.208194 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2190  cobalt ABC transporter permease CbiQ  25.11 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.757374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2143  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  25.11 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2197  cobalt ABC transporter permease protein CbiQ  25.11 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3002  cobalt ABC transporter, permease protein  28.18 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.7 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3890  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.45 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.53 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.916365  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4180  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.86 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0474  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  31.87 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1150  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.84 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2136  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.91 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  27.85 
 
 		 267 aa  49.3  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0034  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.46 
 
 		 254 aa  48.5  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0846524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2565  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.23 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000511957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0994  cobalt ABC transporter, permease protein  25.81 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1353  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.82 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0883  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  37.04 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1929  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.27 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2563  cobalt transport protein  32.5 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.121483 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0134  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.96 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.298184  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0088  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.97 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1795  cobalt ABC transporter CbiQ, inner membrane subunit  25.23 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1452  cobalt transport protein  28.47 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0864828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1102  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.82 
 
 		 270 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2471  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  19.62 
 
 		 248 aa  42  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>