63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2618 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2618  cobalt transport protein  100 
 
 		 242 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1547  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  50.47 
 
 		 238 aa  215  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000302201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3734  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.74 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0430563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1220  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  29.82 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0325  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.04 
 
 		 255 aa  85.5  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.22 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1859  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.82 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0187  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  25.35 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0184  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  24.88 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3822  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.24 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1757  cobalt transport protein  31.3 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2603  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.51 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25508  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0929  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  34.72 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0576637  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1191  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.57 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0529  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.84 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3658  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.95 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.411896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0095  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.7 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1218  cobalt ABC transporter, permease protein  32 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1698  cobalt ABC transporter CbiQ, inner membrane subunit  30.07 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000031286  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1704  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.88 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  35.59 
 
 		 599 aa  72.8  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0144  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.36 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.183976  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1268  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.61 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0727  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.78 
 
 		 257 aa  72  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197575  normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1383  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.36 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1707  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.65 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2593  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.72 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.08926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1295  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.36 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0707234  normal  0.0195569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2148  cobalt transport protein  33.9 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0578  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.23 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.852275  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3207  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  26.63 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1062  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.66 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.104457  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2733  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.94 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436058  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0562  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.52 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2791  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.92 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295927  decreased coverage  0.000165031 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2331  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.58 
 
 		 263 aa  62  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1224  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.39 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00358122  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1005  cobalt transport protein  25.44 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1368  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.7 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.744959  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2471  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.04 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4721  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.28 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.45 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.916365  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3591  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.16 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2243  cobalt ABC transporter permease CbiQ  23.94 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.142646 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2356  cobalt ABC transporter permease CbiQ  23.47 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.208194 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0170  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  34.09 
 
 		 260 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2190  cobalt ABC transporter permease CbiQ  23.47 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.757374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2563  cobalt transport protein  26.28 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.121483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3890  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.08 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2143  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  23.47 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2197  cobalt ABC transporter permease protein CbiQ  23.47 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.57 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0541  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.32 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.906883  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0714  cobalt transport protein  26.35 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1695  cobalt transport protein  31.33 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0792  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.62 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4361  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.43 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1961  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.41 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.688465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4180  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.84 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0474  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  28.46 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1150  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.51 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1928  cobalt transport protein  25.9 
 
 		 238 aa  42  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0883  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.11 
 
 		 279 aa  42  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>