68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0440 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2180  SirA family protein  100 
 
 
77 aa  147  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0440  SirA family protein  100 
 
 
77 aa  147  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.860171  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0354  SirA family protein  62.67 
 
 
79 aa  99  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  32.47 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  32.88 
 
 
80 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  32.43 
 
 
80 aa  51.2  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  32.43 
 
 
80 aa  51.2  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  28.57 
 
 
78 aa  50.4  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  32.47 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  24.32 
 
 
75 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  24.32 
 
 
75 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  24.32 
 
 
75 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  24.32 
 
 
75 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  24.32 
 
 
75 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  31.25 
 
 
200 aa  44.3  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  24.68 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  27.03 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  32.43 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  24.32 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  24.32 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  31.08 
 
 
76 aa  43.5  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  31.08 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  31.08 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  31.08 
 
 
75 aa  43.5  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  31.08 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  27.27 
 
 
78 aa  43.5  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  30.26 
 
 
81 aa  43.5  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  24.32 
 
 
75 aa  42.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.87 
 
 
831 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1828  SirA family protein  31.88 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.263187  normal  0.225214 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1791  SirA family protein  31.88 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1784  SirA family protein  31.88 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832592  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2494  SirA family protein  31.88 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284005  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  30.88 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  25.71 
 
 
76 aa  42  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2236  SirA family protein  35.29 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.278986  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  32.81 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  27.03 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  27.94 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  30.88 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  27.14 
 
 
76 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  24.32 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  28 
 
 
78 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  31.08 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  27.54 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  30.88 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.25 
 
 
813 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  30.88 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  22.97 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  29.41 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
354 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  30 
 
 
354 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
354 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.99 
 
 
938 aa  40.8  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  22.97 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  32.81 
 
 
75 aa  40.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  27.4 
 
 
76 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  27.4 
 
 
76 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  27.4 
 
 
76 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  27.4 
 
 
76 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  27.4 
 
 
76 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  27.94 
 
 
77 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  27.4 
 
 
76 aa  40.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  27.4 
 
 
76 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  27.4 
 
 
76 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  21.62 
 
 
75 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  26.47 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  24.32 
 
 
75 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>