73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3291 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3291  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3432  hypothetical protein  84.75 
 
 		 223 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2727  hypothetical protein  78.03 
 
 		 232 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000603692 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2959  hypothetical protein  76.13 
 
 		 225 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2958  hypothetical protein  72.97 
 
 		 237 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  normal  0.721032 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1396  hypothetical protein  72.52 
 
 		 237 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1419  hypothetical protein  72.52 
 
 		 237 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1380  hypothetical protein  72.07 
 
 		 237 aa  352  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1210  hypothetical protein  70.85 
 
 		 223 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1307  hypothetical protein  72.07 
 
 		 237 aa  351  4e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.970105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1579  hypothetical protein  68.92 
 
 		 235 aa  343  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2642  hypothetical protein  69.82 
 
 		 228 aa  340  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2863  hypothetical protein  69.37 
 
 		 235 aa  339  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2761  hypothetical protein  69.37 
 
 		 237 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2693  hypothetical protein  68.92 
 
 		 237 aa  336  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367941 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1090  hypothetical protein  68.61 
 
 		 223 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.403973 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1742  hypothetical protein  52.47 
 
 		 227 aa  239  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1614  hypothetical protein  44.84 
 
 		 223 aa  205  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2120  hypothetical protein  39.37 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1729  hypothetical protein  45.9 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2601  hypothetical protein  36 
 
 		 228 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00763  hypothetical protein  35.71 
 
 		 228 aa  149  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.727088  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0836  hypothetical protein  33.48 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0324  hypothetical protein  34.67 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0953  hypothetical protein  32.59 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.275204  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0215  hypothetical protein  33.19 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.875175  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0544  hypothetical protein  34.16 
 
 		 231 aa  108  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0019  hypothetical protein  31.86 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000499969  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2092  hypothetical protein  31.51 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0204  hypothetical protein  34.82 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.519496  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5469  hypothetical protein  27.19 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1641  hypothetical protein  33.8 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22484  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0539  hypothetical protein  30.09 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1724  hypothetical protein  31.34 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.047148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1601  hypothetical protein  30.49 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2156  hypothetical protein  35.26 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2390  hypothetical protein  32.46 
 
 		 223 aa  98.2  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1559  hypothetical protein  35.44 
 
 		 201 aa  97.4  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0752407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0426  hypothetical protein  29.36 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3776  hypothetical protein  28.24 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.592704  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1315  hypothetical protein  29.65 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2503  hypothetical protein  28.44 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0772391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4116  hypothetical protein  26.39 
 
 		 261 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0867  hypothetical protein  26.22 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0143  hypothetical protein  30.13 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3079  hypothetical protein  32.8 
 
 		 211 aa  91.7  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5689  hypothetical protein  29.78 
 
 		 218 aa  91.7  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2331  hypothetical protein  29.28 
 
 		 236 aa  91.7  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000057023  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2951  hypothetical protein  28.72 
 
 		 239 aa  91.7  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.282935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1556  hypothetical protein  26.85 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.41693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3594  hypothetical protein  26.39 
 
 		 227 aa  88.6  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1465  hypothetical protein  25.96 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4416  hypothetical protein  29.89 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7980  hypothetical protein  30.43 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167308  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2783  hypothetical protein  33.52 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00806767 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4024  hypothetical protein  26.05 
 
 		 247 aa  84.7  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3090  hypothetical protein  26.24 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.455741  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4216  hypothetical protein  25.58 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0078  hypothetical protein  27.78 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.715697  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3171  hypothetical protein  27.06 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0143  hypothetical protein  25 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2912  hypothetical protein  25.34 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4753  hypothetical protein  24.19 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0076  hypothetical protein  27.78 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000425303  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1755  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.847473  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1375  hypothetical protein  22.83 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1419  hypothetical protein  22.83 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31933  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0005  hypothetical protein  27.91 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.996272  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3771  hypothetical protein  23.5 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0917  hypothetical protein  26.29 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0199611  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07410  conserved hypothetical protein  27.19 
 
 		 456 aa  67  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.788838  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2075  hypothetical protein  27.08 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  hitchhiker  0.0000000208246 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13383  hypothetical protein  21.58 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>