72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0019 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0019  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  464  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000499969  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1465  hypothetical protein  61.09 
 
 
222 aa  309  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1601  hypothetical protein  61.26 
 
 
224 aa  294  7e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0539  hypothetical protein  46.22 
 
 
221 aa  198  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2390  hypothetical protein  41.89 
 
 
223 aa  168  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0215  hypothetical protein  38.22 
 
 
225 aa  162  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.875175  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0324  hypothetical protein  39.56 
 
 
220 aa  162  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2156  hypothetical protein  39.17 
 
 
222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2331  hypothetical protein  39.45 
 
 
236 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000057023  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1559  hypothetical protein  42.71 
 
 
201 aa  158  7e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0752407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0204  hypothetical protein  41.44 
 
 
220 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.519496  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0426  hypothetical protein  37.05 
 
 
223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2092  hypothetical protein  34.7 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0867  hypothetical protein  34.68 
 
 
230 aa  126  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07410  conserved hypothetical protein  32.91 
 
 
456 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.788838  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1729  hypothetical protein  33.18 
 
 
229 aa  114  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1315  hypothetical protein  32.27 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0544  hypothetical protein  33.03 
 
 
231 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1614  hypothetical protein  29.91 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2075  hypothetical protein  33.18 
 
 
226 aa  109  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  hitchhiker  0.0000000208246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3432  hypothetical protein  32.74 
 
 
223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2120  hypothetical protein  32.24 
 
 
232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1090  hypothetical protein  32.74 
 
 
223 aa  108  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.403973 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1742  hypothetical protein  31.82 
 
 
227 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2959  hypothetical protein  33.78 
 
 
225 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00763  hypothetical protein  30.26 
 
 
228 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.727088  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2601  hypothetical protein  28.89 
 
 
228 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0143  hypothetical protein  35.53 
 
 
229 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3291  hypothetical protein  31.86 
 
 
223 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0836  hypothetical protein  28.94 
 
 
228 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1419  hypothetical protein  32.74 
 
 
237 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2958  hypothetical protein  32.74 
 
 
237 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  normal  0.721032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2727  hypothetical protein  32.2 
 
 
232 aa  104  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000603692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1396  hypothetical protein  32.74 
 
 
237 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1380  hypothetical protein  32.74 
 
 
237 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0953  hypothetical protein  28.94 
 
 
228 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.275204  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1307  hypothetical protein  31.86 
 
 
237 aa  102  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.970105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2693  hypothetical protein  31.53 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1210  hypothetical protein  29.87 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1579  hypothetical protein  31.08 
 
 
235 aa  95.9  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2761  hypothetical protein  31.08 
 
 
237 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2863  hypothetical protein  31.22 
 
 
235 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1641  hypothetical protein  31.58 
 
 
223 aa  95.5  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22484  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2642  hypothetical protein  31.11 
 
 
228 aa  93.2  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2503  hypothetical protein  29.07 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0772391  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3171  hypothetical protein  29.55 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3594  hypothetical protein  29.41 
 
 
227 aa  77  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3090  hypothetical protein  28.9 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.455741  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3079  hypothetical protein  27.6 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2951  hypothetical protein  26.79 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.282935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2912  hypothetical protein  27.06 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1556  hypothetical protein  28.77 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.41693  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2783  hypothetical protein  30.84 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00806767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7980  hypothetical protein  24.31 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167308  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3776  hypothetical protein  26.73 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.592704  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13383  hypothetical protein  24.43 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1419  hypothetical protein  24.66 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31933  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1375  hypothetical protein  24.66 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0078  hypothetical protein  30.67 
 
 
229 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.715697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1755  hypothetical protein  25.23 
 
 
234 aa  62.8  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.847473  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5689  hypothetical protein  26.94 
 
 
218 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4416  hypothetical protein  25.57 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5469  hypothetical protein  25.87 
 
 
218 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0005  hypothetical protein  29.94 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.996272  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0076  hypothetical protein  25.23 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000425303  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4216  hypothetical protein  27.82 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3771  hypothetical protein  28.47 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4116  hypothetical protein  23.63 
 
 
261 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1724  hypothetical protein  28.33 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.047148  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4024  hypothetical protein  26.32 
 
 
247 aa  48.9  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0143  hypothetical protein  26.12 
 
 
246 aa  48.5  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4753  hypothetical protein  23.5 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>