58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13383 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13383  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  409  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2092  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1559  hypothetical protein  31.98 
 
 
201 aa  111  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0752407 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0324  hypothetical protein  29.7 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2390  hypothetical protein  31.28 
 
 
223 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2156  hypothetical protein  31.47 
 
 
222 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1315  hypothetical protein  33.76 
 
 
219 aa  102  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2331  hypothetical protein  31.25 
 
 
236 aa  99  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000057023  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0143  hypothetical protein  29.85 
 
 
229 aa  98.2  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0867  hypothetical protein  26.73 
 
 
230 aa  95.1  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0426  hypothetical protein  31.66 
 
 
223 aa  93.2  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0215  hypothetical protein  27.75 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.875175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0539  hypothetical protein  28.57 
 
 
221 aa  85.9  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07410  conserved hypothetical protein  29.33 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.788838  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0204  hypothetical protein  27.55 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.519496  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1729  hypothetical protein  25.79 
 
 
229 aa  77.8  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00763  hypothetical protein  27.27 
 
 
228 aa  77.8  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.727088  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1614  hypothetical protein  26.42 
 
 
223 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2120  hypothetical protein  27.6 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0544  hypothetical protein  31.08 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1742  hypothetical protein  24.87 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1210  hypothetical protein  25.26 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1465  hypothetical protein  23.23 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0836  hypothetical protein  25.39 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1601  hypothetical protein  23.86 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0953  hypothetical protein  25.26 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.275204  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0019  hypothetical protein  24.43 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000499969  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1090  hypothetical protein  25 
 
 
223 aa  63.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.403973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1724  hypothetical protein  26.71 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.047148  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3090  hypothetical protein  30.83 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.455741  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2601  hypothetical protein  26.11 
 
 
228 aa  61.6  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5469  hypothetical protein  25.95 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2959  hypothetical protein  23.2 
 
 
225 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1755  hypothetical protein  24.05 
 
 
234 aa  59.3  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.847473  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1307  hypothetical protein  23.81 
 
 
237 aa  59.3  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.970105  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2912  hypothetical protein  23.98 
 
 
210 aa  58.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1419  hypothetical protein  23.81 
 
 
237 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2727  hypothetical protein  21.58 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000603692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1396  hypothetical protein  23.81 
 
 
237 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2642  hypothetical protein  24.4 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1380  hypothetical protein  23.81 
 
 
237 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2958  hypothetical protein  23.81 
 
 
237 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  normal  0.721032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3079  hypothetical protein  22.99 
 
 
211 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2863  hypothetical protein  25 
 
 
235 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2075  hypothetical protein  21.69 
 
 
226 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  hitchhiker  0.0000000208246 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2693  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2761  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5689  hypothetical protein  23.2 
 
 
218 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3291  hypothetical protein  21.58 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4416  hypothetical protein  25 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3432  hypothetical protein  20.42 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1579  hypothetical protein  22.65 
 
 
235 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2503  hypothetical protein  25.15 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0772391  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7980  hypothetical protein  28.4 
 
 
211 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167308  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3776  hypothetical protein  24.18 
 
 
210 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.592704  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0005  hypothetical protein  23.49 
 
 
216 aa  45.1  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.996272  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2783  hypothetical protein  23.12 
 
 
211 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00806767 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1641  hypothetical protein  25.66 
 
 
223 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>