71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0078 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0078  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  477  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.715697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1556  hypothetical protein  57.21 
 
 
232 aa  278  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.41693  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2951  hypothetical protein  60.47 
 
 
239 aa  271  6e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.282935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3594  hypothetical protein  49.77 
 
 
227 aa  228  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4024  hypothetical protein  47.03 
 
 
247 aa  211  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4216  hypothetical protein  47.49 
 
 
247 aa  210  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0143  hypothetical protein  46.58 
 
 
246 aa  205  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4753  hypothetical protein  45.98 
 
 
233 aa  205  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3771  hypothetical protein  46.12 
 
 
246 aa  202  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4116  hypothetical protein  44.69 
 
 
261 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0076  hypothetical protein  37.33 
 
 
225 aa  156  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000425303  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1380  hypothetical protein  30.86 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2958  hypothetical protein  30.86 
 
 
237 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  normal  0.721032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1419  hypothetical protein  30.86 
 
 
237 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1396  hypothetical protein  30.86 
 
 
237 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1307  hypothetical protein  30.25 
 
 
237 aa  92.4  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.970105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2959  hypothetical protein  29.01 
 
 
225 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1210  hypothetical protein  29.63 
 
 
223 aa  86.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3432  hypothetical protein  29.01 
 
 
223 aa  85.9  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1579  hypothetical protein  26.83 
 
 
235 aa  85.5  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2727  hypothetical protein  29.01 
 
 
232 aa  85.1  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000603692 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1641  hypothetical protein  28.93 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22484  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3291  hypothetical protein  27.78 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2863  hypothetical protein  26.99 
 
 
235 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2761  hypothetical protein  27.78 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1742  hypothetical protein  26.67 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2693  hypothetical protein  26.54 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367941 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1614  hypothetical protein  29.03 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1090  hypothetical protein  28.39 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.403973 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2642  hypothetical protein  26.54 
 
 
228 aa  79  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2912  hypothetical protein  36.3 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3090  hypothetical protein  29.74 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.455741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2503  hypothetical protein  28.88 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0772391  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0539  hypothetical protein  26.92 
 
 
221 aa  72  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0917  hypothetical protein  36.96 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0199611  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0324  hypothetical protein  25.12 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00763  hypothetical protein  29.93 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.727088  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0005  hypothetical protein  30.94 
 
 
216 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.996272  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2783  hypothetical protein  28.44 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00806767 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2601  hypothetical protein  27.27 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1729  hypothetical protein  29.49 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1601  hypothetical protein  34.62 
 
 
224 aa  67  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1419  hypothetical protein  31.21 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31933  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1375  hypothetical protein  31.21 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1755  hypothetical protein  30.32 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.847473  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1724  hypothetical protein  26.22 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.047148  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0019  hypothetical protein  26.91 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000499969  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1315  hypothetical protein  25.73 
 
 
219 aa  63.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2120  hypothetical protein  29.75 
 
 
232 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3171  hypothetical protein  28.16 
 
 
261 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4416  hypothetical protein  30.91 
 
 
213 aa  62.8  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0836  hypothetical protein  27.92 
 
 
228 aa  62.8  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0953  hypothetical protein  27.92 
 
 
228 aa  62.4  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.275204  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0215  hypothetical protein  32.26 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.875175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3079  hypothetical protein  24.77 
 
 
211 aa  58.9  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0426  hypothetical protein  25.35 
 
 
223 aa  58.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5469  hypothetical protein  27.27 
 
 
218 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1465  hypothetical protein  23.74 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3776  hypothetical protein  25.9 
 
 
210 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.592704  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0544  hypothetical protein  31.16 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5689  hypothetical protein  25.14 
 
 
218 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0867  hypothetical protein  23.18 
 
 
230 aa  53.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0143  hypothetical protein  24.88 
 
 
229 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7980  hypothetical protein  24.82 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167308  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2156  hypothetical protein  23.11 
 
 
222 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2331  hypothetical protein  23.36 
 
 
236 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000057023  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2092  hypothetical protein  21.33 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2390  hypothetical protein  24.52 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2075  hypothetical protein  28.39 
 
 
226 aa  47  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  hitchhiker  0.0000000208246 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07410  conserved hypothetical protein  33.75 
 
 
456 aa  46.6  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.788838  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0204  hypothetical protein  23.74 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.519496  normal  0.661186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>