48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1269 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1269  metallophosphoesterase  100 
 
 		 365 aa  756    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1374  metallophosphoesterase  64.53 
 
 		 374 aa  491  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000496232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1182  metallophosphoesterase  64.36 
 
 		 372 aa  481  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1157  metallophosphoesterase  65.96 
 
 		 360 aa  471  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1086  metallophosphoesterase  61.54 
 
 		 385 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0406613  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3480  phosphatase  60.28 
 
 		 384 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1086  metallophosphoesterase  61.63 
 
 		 388 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0953026  normal  0.926855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1152  metallophosphoesterase  61.34 
 
 		 388 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.10308  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3168  metallophosphoesterase  62.33 
 
 		 400 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0458606  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3311  metallophosphoesterase  61.88 
 
 		 400 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.589148  normal  0.0337729 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3167  metallophosphoesterase  61.22 
 
 		 400 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.192452  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1203  metallophosphoesterase  61.05 
 
 		 400 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00203569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1012  hypothetical protein  61.21 
 
 		 346 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1191  metallophosphoesterase  44.61 
 
 		 375 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.37211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0975  metallophosphoesterase  35.55 
 
 		 849 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3146  metallophosphoesterase  36.42 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4610  metallophosphoesterase  25.35 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89674  predicted protein  26.15 
 
 		 359 aa  87.8  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.782489  normal  0.869116 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3839  predicted protein  28.2 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00297256  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38815  predicted protein  24.85 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.677964  normal  0.660881 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02150  conserved hypothetical protein  26.26 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.632375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2170  metallophosphoesterase  25.74 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1549  metallophosphoesterase  27.65 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.253978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0118  metallophosphoesterase  30.82 
 
 		 258 aa  68.9  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  hitchhiker  0.000000000439363 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34100  Calcineurin-like phosphoesterase  26.59 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8809  metallophosphoesterase  27.62 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0293  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.38 
 
 		 1457 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0270  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.38 
 
 		 1457 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0903  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.38 
 
 		 1457 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0475  metallophosphoesterase  24.54 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0978  hypothetical protein  23.57 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0052  metallophosphoesterase  24.31 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  24.9 
 
 		 230 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0050  metallophosphoesterase  24.31 
 
 		 260 aa  50.4  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4812  metallophosphoesterase  24.43 
 
 		 257 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  30.68 
 
 		 230 aa  47  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  27.4 
 
 		 248 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  24.39 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  27.4 
 
 		 248 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  35.8 
 
 		 223 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0061  metallophosphoesterase  25.51 
 
 		 1823 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_200  predicted protein  27.41 
 
 		 923 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238096 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  26.25 
 
 		 268 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0495  metallophosphoesterase  23.75 
 
 		 231 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  30.1 
 
 		 280 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28347  predicted protein  24.88 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0277321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  25 
 
 		 255 aa  43.5  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0367  diadenosine tetraphosphatase  22.41 
 
 		 273 aa  43.5  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>