52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3480 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3480  phosphatase  100 
 
 		 384 aa  801    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1086  metallophosphoesterase  85.49 
 
 		 385 aa  680    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0406613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1152  metallophosphoesterase  85.05 
 
 		 388 aa  676    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.10308  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1086  metallophosphoesterase  85.31 
 
 		 388 aa  678    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0953026  normal  0.926855 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3311  metallophosphoesterase  78.21 
 
 		 400 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.589148  normal  0.0337729 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3168  metallophosphoesterase  78.87 
 
 		 400 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0458606  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1203  metallophosphoesterase  78.59 
 
 		 400 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00203569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3167  metallophosphoesterase  77.75 
 
 		 400 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.192452  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1269  metallophosphoesterase  60.28 
 
 		 365 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1157  metallophosphoesterase  58.73 
 
 		 360 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1374  metallophosphoesterase  58.7 
 
 		 374 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000496232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1182  metallophosphoesterase  60.18 
 
 		 372 aa  442  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1012  hypothetical protein  58.24 
 
 		 346 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1191  metallophosphoesterase  42.01 
 
 		 375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.37211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0975  metallophosphoesterase  34.68 
 
 		 849 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3146  metallophosphoesterase  34.2 
 
 		 358 aa  203  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4610  metallophosphoesterase  25.74 
 
 		 375 aa  99.4  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3839  predicted protein  25.86 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00297256  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89674  predicted protein  26.74 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.782489  normal  0.869116 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02150  conserved hypothetical protein  24.58 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.632375  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38815  predicted protein  25.44 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.677964  normal  0.660881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2170  metallophosphoesterase  23.85 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0118  metallophosphoesterase  27.16 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  hitchhiker  0.000000000439363 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1549  metallophosphoesterase  31.16 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.253978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0978  hypothetical protein  22.02 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8809  metallophosphoesterase  37.21 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0903  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.33 
 
 		 1457 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0293  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.33 
 
 		 1457 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0270  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.33 
 
 		 1457 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0050  metallophosphoesterase  27.08 
 
 		 260 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0475  metallophosphoesterase  26.37 
 
 		 274 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34100  Calcineurin-like phosphoesterase  26.03 
 
 		 276 aa  53.9  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0052  metallophosphoesterase  25.69 
 
 		 267 aa  53.5  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0367  diadenosine tetraphosphatase  24 
 
 		 273 aa  52.8  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  27.18 
 
 		 268 aa  53.1  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  28.19 
 
 		 230 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0159  diadenosine tetraphosphatase  26.37 
 
 		 278 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28347  predicted protein  22.26 
 
 		 290 aa  49.7  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0277321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_200  predicted protein  29.41 
 
 		 923 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238096 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  23.79 
 
 		 230 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6039  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  25.48 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.647545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  36.59 
 
 		 223 aa  46.6  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  23.35 
 
 		 248 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  23.35 
 
 		 248 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2853  diadenosine tetraphosphatase  24.73 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1345  diadenosine tetraphosphatase  23.59 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.399511  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0598  diadenosine tetraphosphatase  29.66 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.158681  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2993  diadenosine tetraphosphatase  24.73 
 
 		 276 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  26.19 
 
 		 255 aa  43.9  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00164  hypothetical protein similar to ser/Thr protein phosphatase (Broad)  26.97 
 
 		 281 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000203729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3236  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  24.39 
 
 		 260 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1555  serine/threonine protein phosphatase, putative  29.67 
 
 		 241 aa  43.1  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0307054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>