17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0978 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0978  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3146  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
358 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0975  metallophosphoesterase  31.11 
 
 
849 aa  86.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1374  metallophosphoesterase  23.49 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000496232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1157  metallophosphoesterase  27.5 
 
 
360 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3167  metallophosphoesterase  23.35 
 
 
400 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.192452  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1152  metallophosphoesterase  22.16 
 
 
388 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.10308  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1086  metallophosphoesterase  22.16 
 
 
388 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0953026  normal  0.926855 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3311  metallophosphoesterase  22.75 
 
 
400 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.589148  normal  0.0337729 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3168  metallophosphoesterase  22.75 
 
 
400 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0458606  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1203  metallophosphoesterase  22.75 
 
 
400 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00203569  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1012  hypothetical protein  26.54 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1269  metallophosphoesterase  22.92 
 
 
365 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3480  phosphatase  22.02 
 
 
384 aa  58.9  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1182  metallophosphoesterase  22.78 
 
 
372 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1086  metallophosphoesterase  21.56 
 
 
385 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0406613  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1191  metallophosphoesterase  26.18 
 
 
375 aa  52.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.37211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>