92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1012 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1012  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  712    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1182  metallophosphoesterase  60.12 
 
 
372 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1152  metallophosphoesterase  60.55 
 
 
388 aa  424  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.10308  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1086  metallophosphoesterase  60.86 
 
 
388 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0953026  normal  0.926855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1086  metallophosphoesterase  58.11 
 
 
385 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0406613  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3480  phosphatase  58.24 
 
 
384 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1269  metallophosphoesterase  61.21 
 
 
365 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1157  metallophosphoesterase  58.19 
 
 
360 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3168  metallophosphoesterase  61.45 
 
 
400 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0458606  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3311  metallophosphoesterase  61.45 
 
 
400 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.589148  normal  0.0337729 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1203  metallophosphoesterase  60.84 
 
 
400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00203569  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3167  metallophosphoesterase  60.54 
 
 
400 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.192452  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1374  metallophosphoesterase  56.72 
 
 
374 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000496232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1191  metallophosphoesterase  45.37 
 
 
375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.37211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3146  metallophosphoesterase  35.91 
 
 
358 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0975  metallophosphoesterase  34.11 
 
 
849 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4610  metallophosphoesterase  28.52 
 
 
375 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3839  predicted protein  29.89 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00297256  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02150  conserved hypothetical protein  28.06 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.632375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2170  metallophosphoesterase  27.31 
 
 
374 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1549  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.253978  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38815  predicted protein  25.09 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.677964  normal  0.660881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0475  metallophosphoesterase  29.04 
 
 
274 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89674  predicted protein  26.79 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.782489  normal  0.869116 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0118  metallophosphoesterase  25.2 
 
 
258 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  hitchhiker  0.000000000439363 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34100  Calcineurin-like phosphoesterase  26.67 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8809  metallophosphoesterase  32.62 
 
 
298 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0293  Ser/Thr protein phosphatase family protein  43.59 
 
 
1457 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0052  metallophosphoesterase  27.38 
 
 
267 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0270  Ser/Thr protein phosphatase family protein  43.59 
 
 
1457 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0903  Ser/Thr protein phosphatase family protein  43.59 
 
 
1457 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0050  metallophosphoesterase  26.23 
 
 
260 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0978  hypothetical protein  24.38 
 
 
289 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  29.37 
 
 
248 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  29.37 
 
 
248 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  30.67 
 
 
230 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28347  predicted protein  29.02 
 
 
290 aa  53.1  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0277321  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  28.07 
 
 
250 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  30.34 
 
 
251 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3968  diadenosine tetraphosphatase  26.54 
 
 
279 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.383712  normal  0.638877 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  29.05 
 
 
209 aa  50.4  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  28 
 
 
230 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2859  diadenosine tetraphosphatase  26.62 
 
 
269 aa  50.1  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000394159  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1028  metallophosphoesterase  32.65 
 
 
209 aa  49.3  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6039  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  29.61 
 
 
272 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.647545  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  30.38 
 
 
255 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  27.78 
 
 
268 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_200  predicted protein  30.97 
 
 
923 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0238096 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  27.45 
 
 
230 aa  47.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4812  metallophosphoesterase  34.57 
 
 
257 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709692  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0562  diadenosine tetraphosphatase  28.67 
 
 
288 aa  47.8  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2890  diadenosine tetraphosphatase  26.54 
 
 
273 aa  47  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.312502  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  26.25 
 
 
251 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0760  diadenosine tetraphosphatase  26.16 
 
 
279 aa  46.2  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00806  diadenosine tetraphosphatase  25.53 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  32.22 
 
 
235 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  35.16 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0743  diadenosine tetraphosphatase  26.63 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0092  diadenosine tetraphosphatase  26.4 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.533237 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0097  diadenosine tetraphosphatase  26.4 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0099  diadenosine tetraphosphatase  26.4 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0094  diadenosine tetraphosphatase  26.4 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0093  diadenosine tetraphosphatase  26.4 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.413361 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3637  diadenosine tetraphosphatase  27.08 
 
 
281 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2013  metallophosphoesterase  31.4 
 
 
323 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0029  metallophosphoesterase  25.32 
 
 
218 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3729  metallophosphoesterase  31.4 
 
 
323 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0625  diadenosine tetraphosphatase  26.57 
 
 
282 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3834  diadenosine tetraphosphatase  28.97 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0722  diadenosine tetraphosphatase  27.78 
 
 
283 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0598  diadenosine tetraphosphatase  28.24 
 
 
282 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.158681  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2156  diadenosine tetraphosphatase  27.81 
 
 
281 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.699429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2943  metallophosphoesterase  31.58 
 
 
324 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111879  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  29.55 
 
 
234 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0159  diadenosine tetraphosphatase  27.97 
 
 
278 aa  43.5  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2853  diadenosine tetraphosphatase  26.49 
 
 
276 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1149  diadenosine tetraphosphatase  26.18 
 
 
280 aa  43.9  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  29.55 
 
 
234 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2196  metallophosphoesterase  34.21 
 
 
323 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1573  metallophosphoesterase  30.23 
 
 
323 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24274 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  26.21 
 
 
254 aa  43.5  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  28.41 
 
 
234 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1545  metallophosphoesterase  30.23 
 
 
323 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.556937  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  25 
 
 
236 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  29.09 
 
 
265 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2071  diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatase  28.75 
 
 
337 aa  42.7  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125008  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2993  diadenosine tetraphosphatase  26.49 
 
 
276 aa  42.7  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  29.55 
 
 
234 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  29.55 
 
 
234 aa  42.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  29.55 
 
 
234 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  29.55 
 
 
234 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1046  diadenosine tetraphosphatase  28.76 
 
 
276 aa  42.7  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.78168  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>