26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9416 on replicon NC_013596
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013596  Sros_9416    100 
 
 		 901 bp  1786    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  99.33 
 
 		 891 bp  1711    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4687    100 
 
 		 901 bp  1786    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241727  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4818  integrase catalytic subunit  83.33 
 
 		 624 bp  151  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  91.84 
 
 		 858 bp  65.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  91.84 
 
 		 858 bp  65.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  91.84 
 
 		 858 bp  65.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  91.84 
 
 		 858 bp  65.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  91.84 
 
 		 858 bp  65.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  91.84 
 
 		 858 bp  65.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  91.84 
 
 		 858 bp  65.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  91.84 
 
 		 858 bp  65.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  91.84 
 
 		 858 bp  65.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  91.84 
 
 		 858 bp  65.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  91.84 
 
 		 858 bp  65.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  89.29 
 
 		 960 bp  63.9  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5606  integrase catalytic subunit  93.94 
 
 		 900 bp  50.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398983  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  85.96 
 
 		 876 bp  50.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  85.96 
 
 		 876 bp  50.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  85.96 
 
 		 876 bp  50.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  100 
 
 		 1353 bp  50.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5824  integrase catalytic subunit  93.94 
 
 		 900 bp  50.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.360076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2517    91.67 
 
 		 216 bp  48.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3741  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 		 834 bp  48.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0583  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 		 900 bp  48.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0575  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 		 900 bp  48.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>