19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6539 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6539  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  360  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  hitchhiker  0.00117101 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0874  hypothetical protein  49.3 
 
 		 246 aa  132  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379779  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1088  hypothetical protein  49.3 
 
 		 234 aa  125  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826952  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2212  hypothetical protein  60.17 
 
 		 299 aa  123  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.903413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2458  hypothetical protein  51.39 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2955  hypothetical protein  40.7 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00243568  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1477  hypothetical protein  42.86 
 
 		 293 aa  94.4  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000119083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22500  hypothetical protein  40 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1097  hypothetical protein  37.5 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.481464  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1618  hypothetical protein  37.96 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5487  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.01 
 
 		 671 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2388  hypothetical protein  44.53 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3183  hypothetical protein  40 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.104074  normal  0.183723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1312  hypothetical protein  37.5 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1727  hypothetical protein  35.94 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00463945  hitchhiker  0.00188922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3172  hypothetical protein  37.74 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1474  hypothetical protein  32.97 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550643  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21940  hypothetical protein  38.03 
 
 		 271 aa  54.3  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131967  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12240  phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase  31.19 
 
 		 470 aa  42.4  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134521  normal  0.180606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>