19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2458 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2458  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  333  9e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1088  hypothetical protein  46.72 
 
 		 234 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6539  hypothetical protein  51.39 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  hitchhiker  0.00117101 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0874  hypothetical protein  44.59 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379779  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5487  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.23 
 
 		 671 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1097  hypothetical protein  37.74 
 
 		 247 aa  88.6  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.481464  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2955  hypothetical protein  41.77 
 
 		 253 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00243568  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1477  hypothetical protein  46.09 
 
 		 293 aa  84.3  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000119083 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3172  hypothetical protein  46.96 
 
 		 182 aa  84  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1618  hypothetical protein  40.88 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1312  hypothetical protein  43.88 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2388  hypothetical protein  41.1 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22500  hypothetical protein  41.22 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2212  hypothetical protein  51.28 
 
 		 299 aa  71.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.903413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3183  hypothetical protein  42.4 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.104074  normal  0.183723 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21940  hypothetical protein  41.32 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1727  hypothetical protein  38.4 
 
 		 391 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00463945  hitchhiker  0.00188922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1474  hypothetical protein  44.19 
 
 		 309 aa  54.7  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550643  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12240  phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase  35.48 
 
 		 470 aa  45.4  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134521  normal  0.180606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>