20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2955 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2955  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  502  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00243568  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1088  hypothetical protein  42.19 
 
 
234 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0874  hypothetical protein  40.97 
 
 
246 aa  162  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379779  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6539  hypothetical protein  40.7 
 
 
184 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  hitchhiker  0.00117101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2458  hypothetical protein  42.41 
 
 
175 aa  89  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3172  hypothetical protein  43.51 
 
 
182 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1312  hypothetical protein  36.54 
 
 
262 aa  81.6  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1618  hypothetical protein  32.7 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22500  hypothetical protein  32.91 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1097  hypothetical protein  32.18 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.481464  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2212  hypothetical protein  44.87 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.903413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2388  hypothetical protein  33.8 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1477  hypothetical protein  35.85 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000119083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1474  hypothetical protein  32.26 
 
 
309 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550643  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3183  hypothetical protein  31.94 
 
 
297 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.104074  normal  0.183723 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21940  hypothetical protein  33.04 
 
 
271 aa  55.5  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5487  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.51 
 
 
671 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153721  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12240  phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase  36 
 
 
470 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134521  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1727  hypothetical protein  33.8 
 
 
391 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00463945  hitchhiker  0.00188922 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1252  outer membrane autotransporter  25.71 
 
 
138 aa  44.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.018155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>