18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1727 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1727  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  719    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00463945  hitchhiker  0.00188922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3183  hypothetical protein  48.41 
 
 
297 aa  159  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.104074  normal  0.183723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1477  hypothetical protein  44.27 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000119083 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1097  hypothetical protein  41.04 
 
 
247 aa  69.3  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.481464  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0874  hypothetical protein  37.3 
 
 
246 aa  67  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379779  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5487  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.65 
 
 
671 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153721  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1618  hypothetical protein  37.88 
 
 
280 aa  59.7  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22500  hypothetical protein  39.72 
 
 
261 aa  56.2  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1312  hypothetical protein  37.39 
 
 
262 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1088  hypothetical protein  35.71 
 
 
234 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826952  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12240  phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase  41.35 
 
 
470 aa  54.3  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134521  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1474  hypothetical protein  43.04 
 
 
309 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6539  hypothetical protein  33.96 
 
 
184 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  hitchhiker  0.00117101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2212  hypothetical protein  38.57 
 
 
299 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.903413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3172  hypothetical protein  41.79 
 
 
182 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2955  hypothetical protein  38.78 
 
 
253 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00243568  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2388  hypothetical protein  37.35 
 
 
237 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2458  hypothetical protein  37.37 
 
 
175 aa  43.1  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>