20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1312 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1312  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  494  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22500  hypothetical protein  69.23 
 
 
261 aa  272  5.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1618  hypothetical protein  61.25 
 
 
280 aa  226  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1097  hypothetical protein  55.33 
 
 
247 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.481464  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2388  hypothetical protein  51.01 
 
 
237 aa  178  9e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3172  hypothetical protein  46.67 
 
 
182 aa  125  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1477  hypothetical protein  40 
 
 
293 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000119083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1474  hypothetical protein  41.84 
 
 
309 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550643  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21940  hypothetical protein  37.78 
 
 
271 aa  102  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0874  hypothetical protein  35.4 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379779  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5487  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.28 
 
 
671 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153721  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1088  hypothetical protein  34.4 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826952  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2955  hypothetical protein  36.54 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00243568  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2458  hypothetical protein  43.88 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3183  hypothetical protein  38.69 
 
 
297 aa  68.6  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.104074  normal  0.183723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6539  hypothetical protein  37.5 
 
 
184 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  hitchhiker  0.00117101 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12240  phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase  38.69 
 
 
470 aa  62  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134521  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07410  hypothetical protein  37.25 
 
 
162 aa  61.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.475493  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1727  hypothetical protein  37.78 
 
 
391 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00463945  hitchhiker  0.00188922 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07400  hypothetical protein  38.78 
 
 
175 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>