42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0211 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0211  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8170  hypothetical protein  48.92 
 
 
648 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8172  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  39.04 
 
 
660 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.71 
 
 
878 aa  85.9  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2539  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.33 
 
 
452 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000815252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.28 
 
 
1078 aa  68.2  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.89 
 
 
453 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263259  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.34 
 
 
1060 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4195  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.16 
 
 
1086 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  40.91 
 
 
1285 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.1 
 
 
891 aa  51.6  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4203  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  40.85 
 
 
1333 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5318  hitchhiker  0.00171277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4136  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.19 
 
 
1110 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.34 
 
 
860 aa  49.3  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.31 
 
 
1065 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  41.94 
 
 
860 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0871  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  41.67 
 
 
1078 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2054  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.23 
 
 
407 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3754  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 
1153 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  36.36 
 
 
1239 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.69 
 
 
883 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1449  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.34 
 
 
446 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1426  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.46 
 
 
1241 aa  45.1  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.123666  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  31.37 
 
 
489 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2457  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.49 
 
 
678 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.551982 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0509  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.76 
 
 
412 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00169266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  36.07 
 
 
826 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3502  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  48 
 
 
1106 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250656  hitchhiker  0.00117601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4538  outer membrane autotransporter barrel domain protein  48.78 
 
 
710 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  37.1 
 
 
1324 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  34.94 
 
 
1321 aa  42.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0676  proteinase, putative  28.36 
 
 
885 aa  42.7  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.49 
 
 
1234 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719877  normal  0.242964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4602  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  37.1 
 
 
1340 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823259  normal  0.0573734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.1 
 
 
1253 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  42.86 
 
 
485 aa  42  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.72 
 
 
442 aa  42  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.883055  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1195  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.49 
 
 
482 aa  41.6  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0314  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  39.68 
 
 
1172 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.498901  normal  0.380582 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1465  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.82 
 
 
1230 aa  41.6  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  28.95 
 
 
1739 aa  41.6  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6213  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  58.62 
 
 
1079 aa  41.6  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>