30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2953 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2953  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  254  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3275  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.612674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72920  hypothetical protein  35.48 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3226  hypothetical protein  33.96 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0633516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6328  hypothetical protein  34.41 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5518  hypothetical protein  32.48 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5647  hypothetical protein  31.62 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5067  hypothetical protein  30.77 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0909  hypothetical protein  24.77 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3511  hypothetical protein  27.52 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5132  hypothetical protein  28.21 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.161261 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2616  hypothetical protein  28.92 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.942508  normal  0.708166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5354  hypothetical protein  28.21 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206847  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4522  hypothetical protein  29.91 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0683  hypothetical protein  24.78 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00839413  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3750  hypothetical protein  24.78 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.154737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3559  hypothetical protein  24.78 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0452372  normal  0.150026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3627  hypothetical protein  24.78 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0757  hypothetical protein  27.62 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.299763  normal  0.176854 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0785  hypothetical protein  27.62 
 
 		 135 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486854  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5403  hypothetical protein  29.06 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0757448 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3181  hypothetical protein  27.62 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.685781  normal  0.0661011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00400  hypothetical protein  33.01 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3847  hypothetical protein  27.62 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5262  hypothetical protein  27.35 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0789  hypothetical protein  24.76 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2971  hypothetical protein  22.02 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000061092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0840  hypothetical protein  23.81 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00324718  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0741  hypothetical protein  24.53 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000832007  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1553  hypothetical protein  24.72 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>