31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3226 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3226  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  285  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0633516  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3275  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.612674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5647  hypothetical protein  29.41 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5132  hypothetical protein  29.41 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.161261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5354  hypothetical protein  28.68 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206847  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5518  hypothetical protein  29.41 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5403  hypothetical protein  29.41 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0757448 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5067  hypothetical protein  28.68 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5262  hypothetical protein  27.94 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0909  hypothetical protein  26.52 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00400  hypothetical protein  29.85 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3511  hypothetical protein  26.87 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6328  hypothetical protein  34.41 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72920  hypothetical protein  34.41 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2953  hypothetical protein  33.96 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2616  hypothetical protein  25.37 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.942508  normal  0.708166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0683  hypothetical protein  25.76 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00839413  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3750  hypothetical protein  25.76 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.154737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3627  hypothetical protein  25.76 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3559  hypothetical protein  25.76 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0452372  normal  0.150026 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2971  hypothetical protein  24.24 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000061092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4522  hypothetical protein  25.36 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0741  hypothetical protein  24.06 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000832007  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0785  hypothetical protein  24.24 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486854  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1553  hypothetical protein  28.79 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0757  hypothetical protein  24.24 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.299763  normal  0.176854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3181  hypothetical protein  24.24 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.685781  normal  0.0661011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0789  hypothetical protein  25 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0840  hypothetical protein  23.31 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00324718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3847  hypothetical protein  24.24 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3179  hypothetical protein  26.87 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.244795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>