31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0789 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0789  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  278  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0757  hypothetical protein  91.85 
 
 
135 aa  262  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.299763  normal  0.176854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3181  hypothetical protein  91.85 
 
 
135 aa  262  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.685781  normal  0.0661011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3847  hypothetical protein  91.11 
 
 
135 aa  261  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0785  hypothetical protein  91.11 
 
 
135 aa  261  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486854  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3559  hypothetical protein  91.85 
 
 
135 aa  258  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0452372  normal  0.150026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3627  hypothetical protein  91.85 
 
 
135 aa  258  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0683  hypothetical protein  91.85 
 
 
135 aa  258  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00839413  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3750  hypothetical protein  91.11 
 
 
135 aa  256  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.154737  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0840  hypothetical protein  76.69 
 
 
133 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00324718  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2971  hypothetical protein  77.1 
 
 
133 aa  216  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000061092  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0741  hypothetical protein  75.19 
 
 
133 aa  214  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000832007  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2616  hypothetical protein  71.43 
 
 
133 aa  205  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.942508  normal  0.708166 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0909  hypothetical protein  69.92 
 
 
133 aa  201  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170029  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3511  hypothetical protein  70.68 
 
 
133 aa  201  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142709  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00400  hypothetical protein  59.26 
 
 
135 aa  171  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3179  hypothetical protein  67.16 
 
 
134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.244795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4522  hypothetical protein  57.04 
 
 
135 aa  164  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5132  hypothetical protein  54.41 
 
 
135 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.161261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5647  hypothetical protein  54.07 
 
 
135 aa  157  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0156026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5067  hypothetical protein  53.33 
 
 
135 aa  157  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5354  hypothetical protein  52.59 
 
 
135 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206847  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5518  hypothetical protein  53.33 
 
 
135 aa  155  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5262  hypothetical protein  52.59 
 
 
135 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5403  hypothetical protein  51.85 
 
 
135 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0757448 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1553  hypothetical protein  48.87 
 
 
134 aa  142  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72920  hypothetical protein  52.63 
 
 
133 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6328  hypothetical protein  52.63 
 
 
133 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3275  hypothetical protein  24.81 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.612674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3226  hypothetical protein  25 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0633516  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2953  hypothetical protein  24.76 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>