31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5403 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5403  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  268  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0757448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5262  hypothetical protein  94.81 
 
 		 135 aa  258  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5132  hypothetical protein  94.81 
 
 		 135 aa  256  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.161261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5354  hypothetical protein  94.07 
 
 		 135 aa  254  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206847  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5067  hypothetical protein  93.33 
 
 		 135 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5518  hypothetical protein  91.85 
 
 		 135 aa  248  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5647  hypothetical protein  89.63 
 
 		 135 aa  246  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156026 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00400  hypothetical protein  72.59 
 
 		 135 aa  204  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4522  hypothetical protein  71.11 
 
 		 135 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2616  hypothetical protein  57.04 
 
 		 133 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.942508  normal  0.708166 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2971  hypothetical protein  56.39 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000061092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0741  hypothetical protein  57.78 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000832007  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0840  hypothetical protein  57.89 
 
 		 133 aa  160  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00324718  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0757  hypothetical protein  53.33 
 
 		 135 aa  153  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.299763  normal  0.176854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3181  hypothetical protein  53.33 
 
 		 135 aa  153  8e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.685781  normal  0.0661011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72920  hypothetical protein  77.04 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0789  hypothetical protein  51.85 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6328  hypothetical protein  77.04 
 
 		 133 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3847  hypothetical protein  53.33 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3559  hypothetical protein  52.24 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0452372  normal  0.150026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3627  hypothetical protein  52.24 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0785  hypothetical protein  52.59 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486854  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0683  hypothetical protein  52.24 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00839413  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0909  hypothetical protein  51.09 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3750  hypothetical protein  51.49 
 
 		 135 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.154737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3511  hypothetical protein  48.89 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1553  hypothetical protein  53.33 
 
 		 134 aa  147  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3179  hypothetical protein  53.33 
 
 		 134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.244795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3226  hypothetical protein  29.41 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0633516  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3275  hypothetical protein  27.74 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.612674  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2953  hypothetical protein  29.06 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>