45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4926 on replicon NC_009829
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009829  Spro_4926  nuclease  100 
 
 
459 aa  954    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.614289 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0831  nuclease  41.82 
 
 
259 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  37.84 
 
 
411 aa  50.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  37.89 
 
 
408 aa  50.1  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.13 
 
 
421 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  30 
 
 
303 aa  47.8  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  39.06 
 
 
255 aa  46.2  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1473  chromosome partitioning protein  38.89 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  30.83 
 
 
293 aa  45.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  30.3 
 
 
283 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  43.94 
 
 
323 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  30.83 
 
 
293 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  30.83 
 
 
293 aa  45.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  40.35 
 
 
452 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  40.35 
 
 
452 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  29.7 
 
 
297 aa  45.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  31.06 
 
 
283 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  31.06 
 
 
283 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0021  ParB family protein  32.94 
 
 
320 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  26.72 
 
 
285 aa  44.3  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  34.78 
 
 
444 aa  44.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  32.35 
 
 
413 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  41.54 
 
 
417 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  42.19 
 
 
432 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  30.47 
 
 
306 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1285  hypothetical protein  33.8 
 
 
211 aa  44.7  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0408656  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  34.78 
 
 
444 aa  44.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  30.77 
 
 
283 aa  44.3  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  25.77 
 
 
450 aa  43.9  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  30.3 
 
 
256 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0599  ParB-like nuclease domain-containing protein  42.11 
 
 
94 aa  44.3  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0661  ParB-like nuclease domain-containing protein  42.11 
 
 
94 aa  44.3  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  30.51 
 
 
293 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  30.3 
 
 
283 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  24.1 
 
 
286 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  24.1 
 
 
286 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  30.23 
 
 
280 aa  43.5  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  39.73 
 
 
280 aa  43.5  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  30.97 
 
 
256 aa  43.5  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  30.97 
 
 
283 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  28.27 
 
 
294 aa  43.5  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  34.78 
 
 
411 aa  43.5  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  30.97 
 
 
283 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  30.97 
 
 
283 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  30.97 
 
 
283 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>