19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3388 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3388  hypothetical protein  100 
 
 
756 aa  1522    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6186  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2454  hypothetical protein  38.5 
 
 
767 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0594275  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1525  hypothetical protein  33.13 
 
 
188 aa  94.7  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1115  hypothetical protein  37.7 
 
 
183 aa  87  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02159  hypothetical protein  40.16 
 
 
280 aa  83.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06320  hypothetical protein  33.06 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3643  hypothetical protein  31.1 
 
 
196 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2224  hypothetical protein  28.46 
 
 
343 aa  64.3  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0783  Lanthionine synthetase C family protein  30.45 
 
 
1074 aa  62.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265394  normal  0.258057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5573  hypothetical protein  28.79 
 
 
203 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1361  hypothetical protein  26.36 
 
 
320 aa  61.2  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5242  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  60.8  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.577822 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1765  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  59.3  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.97626  normal  0.455491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0767  hypothetical protein  28.1 
 
 
218 aa  54.3  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.635785  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1805  hypothetical protein  38.32 
 
 
379 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0261  hypothetical protein  29.13 
 
 
286 aa  52  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1944  hypothetical protein  29.52 
 
 
191 aa  50.4  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2021  hypothetical protein  31.93 
 
 
191 aa  47  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0238  lanthionine synthetase C-like  22.44 
 
 
1058 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0581031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>