17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1115 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1115  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  378  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1525  hypothetical protein  79.01 
 
 
188 aa  296  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5573  hypothetical protein  37.87 
 
 
203 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06320  hypothetical protein  34.57 
 
 
199 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02159  hypothetical protein  34.29 
 
 
280 aa  97.1  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1361  hypothetical protein  37.5 
 
 
320 aa  87  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3388  hypothetical protein  37.7 
 
 
756 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6186  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2454  hypothetical protein  29.55 
 
 
767 aa  80.5  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0594275  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3643  hypothetical protein  32.77 
 
 
196 aa  74.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2224  hypothetical protein  34.33 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5242  hypothetical protein  31.41 
 
 
221 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.577822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0261  hypothetical protein  28.47 
 
 
286 aa  62.8  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0767  hypothetical protein  29.73 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.635785  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1944  hypothetical protein  27.61 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2021  hypothetical protein  25.29 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1805  hypothetical protein  30.08 
 
 
379 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1884  hypothetical protein  45 
 
 
151 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>