19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1361 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1361  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  654    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2224  hypothetical protein  37.07 
 
 
343 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3643  hypothetical protein  34.57 
 
 
196 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1525  hypothetical protein  35.77 
 
 
188 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1115  hypothetical protein  37.5 
 
 
183 aa  87  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02159  hypothetical protein  25.18 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2454  hypothetical protein  31.03 
 
 
767 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0594275  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5573  hypothetical protein  29.32 
 
 
203 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5242  hypothetical protein  30.63 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.577822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0767  hypothetical protein  28.27 
 
 
218 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.635785  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1765  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  67  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.97626  normal  0.455491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3388  hypothetical protein  26.36 
 
 
756 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6186  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2507  hypothetical protein  35.64 
 
 
428 aa  59.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0261  hypothetical protein  26.92 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06320  hypothetical protein  31.03 
 
 
199 aa  57.4  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1944  hypothetical protein  29.57 
 
 
191 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5400  hypothetical protein  30.85 
 
 
397 aa  53.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2021  hypothetical protein  28.7 
 
 
191 aa  50.4  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.93 
 
 
841 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>