18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1525 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1525  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  388  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1115  hypothetical protein  79.01 
 
 
183 aa  296  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06320  hypothetical protein  31.48 
 
 
199 aa  105  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5573  hypothetical protein  35.12 
 
 
203 aa  99.4  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02159  hypothetical protein  33.73 
 
 
280 aa  96.3  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3388  hypothetical protein  33.13 
 
 
756 aa  94.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6186  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1361  hypothetical protein  35.77 
 
 
320 aa  88.6  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2454  hypothetical protein  30.29 
 
 
767 aa  80.9  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0594275  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3643  hypothetical protein  35.9 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2224  hypothetical protein  35.34 
 
 
343 aa  71.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0261  hypothetical protein  29.5 
 
 
286 aa  67  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5242  hypothetical protein  31.33 
 
 
221 aa  63.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.577822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0767  hypothetical protein  28.49 
 
 
218 aa  62  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.635785  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1944  hypothetical protein  26.92 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1805  hypothetical protein  31.2 
 
 
379 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2021  hypothetical protein  24 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1884  hypothetical protein  42.59 
 
 
151 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1765  hypothetical protein  40 
 
 
240 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.97626  normal  0.455491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>