13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0261 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0261  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  597  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1525  hypothetical protein  29.5 
 
 
188 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1115  hypothetical protein  28.47 
 
 
183 aa  62.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1361  hypothetical protein  26.92 
 
 
320 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3388  hypothetical protein  29.13 
 
 
756 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6186  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0772  hypothetical protein  34.57 
 
 
555 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840859  normal  0.0209356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5149  ankyrin  28.09 
 
 
589 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377523  normal  0.510979 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3447  hypothetical protein  33.33 
 
 
555 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319087  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4920  hypothetical protein  33.33 
 
 
555 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.186721  normal  0.0651204 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0068  ankyrin  30.86 
 
 
534 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5367  hypothetical protein  32.93 
 
 
555 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0331655  normal  0.148887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2372  ankyrin  27.06 
 
 
519 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2224  hypothetical protein  25 
 
 
343 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.28777 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>