15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2224 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2224  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  712    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1361  hypothetical protein  37.07 
 
 
320 aa  176  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3643  hypothetical protein  32.39 
 
 
196 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1115  hypothetical protein  34.33 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1525  hypothetical protein  35.34 
 
 
188 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5242  hypothetical protein  31.97 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.577822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0767  hypothetical protein  29.59 
 
 
218 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.635785  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02159  hypothetical protein  30.95 
 
 
280 aa  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3388  hypothetical protein  28.46 
 
 
756 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6186  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1765  hypothetical protein  38.89 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.97626  normal  0.455491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2454  hypothetical protein  27.69 
 
 
767 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0594275  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5573  hypothetical protein  27.14 
 
 
203 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1805  hypothetical protein  31.78 
 
 
379 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06320  hypothetical protein  27.87 
 
 
199 aa  43.5  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0261  hypothetical protein  25 
 
 
286 aa  42.7  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>