27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0238 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0238  lanthionine synthetase C-like  100 
 
 
1058 aa  2178    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0581031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1868  lanthionine synthetase C family protein  40.04 
 
 
1080 aa  713    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3486  Lanthionine synthetase C family protein  34.84 
 
 
1093 aa  576  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0546748  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3047  Lanthionine synthetase C family protein  33.43 
 
 
1088 aa  495  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.318736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3979  Lanthionine synthetase C family protein  33.09 
 
 
1117 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.027595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5238  Lanthionine synthetase C family protein  33.74 
 
 
1129 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1243  lanthionine synthetase (lantibiotic biosynthesis)  32.03 
 
 
989 aa  441  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2897  Lanthionine synthetase C family protein  34.88 
 
 
1126 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.965177 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1107  Lanthionine synthetase C family protein  30.77 
 
 
1040 aa  422  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0940946  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0349  lanthionine synthetase C family protein  31.73 
 
 
996 aa  399  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3731  Lanthionine synthetase C family protein  32.48 
 
 
1012 aa  399  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.760247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2006  Lanthionine synthetase C family protein  31.91 
 
 
1078 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.517498  normal  0.231336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1979  Lanthionine synthetase C family protein  31.48 
 
 
1078 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0783  Lanthionine synthetase C family protein  28.65 
 
 
1074 aa  347  5e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265394  normal  0.258057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3738  lanthionine synthetase C-like  36.09 
 
 
611 aa  319  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207204  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21071  MrsD-like protein  30.79 
 
 
1068 aa  295  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.365739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5313  Lanthionine synthetase C family protein  34.36 
 
 
1013 aa  294  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0569792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4441  Lanthionine synthetase C family protein  28.25 
 
 
959 aa  278  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.385219 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1651  lantibiotic modifying enzyme  23.07 
 
 
1033 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.36671  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6089  lanthionine synthetase C family protein  26.65 
 
 
973 aa  196  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4908  putative lantibiotic modification protein  30.79 
 
 
568 aa  170  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4228  Lanthionine synthetase C family protein  26.17 
 
 
661 aa  132  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5326  Lanthionine synthetase C family protein  24.26 
 
 
614 aa  91.3  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09700  lantibiotic modifying enzyme  18.68 
 
 
610 aa  76.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1493  Lanthionine synthetase C family protein  28.85 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.126791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3154  serine/threonine protein kinase  24.22 
 
 
713 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7172  serine/threonine protein kinase  23.1 
 
 
861 aa  50.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>