17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3204 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3204  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  442  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20809  unclonable  0.0000000000140296 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0401  hypothetical protein  57.92 
 
 
216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0121  hypothetical protein  37.1 
 
 
219 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0298502  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0084  hypothetical protein  39.02 
 
 
217 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14460  hypothetical protein  37.09 
 
 
226 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0045  hypothetical protein  38.27 
 
 
218 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5845  hypothetical protein  33.5 
 
 
215 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0784  hypothetical protein  29.41 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12250  hypothetical protein  32.51 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1385  hypothetical protein  30.81 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107247  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1965  hypothetical protein  35.37 
 
 
226 aa  62.4  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0766  hypothetical protein  30.64 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.987289  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5815  hypothetical protein  27.7 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0267  hypothetical protein  27.8 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.202879  normal  0.132358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5198  hypothetical protein  28.31 
 
 
275 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0646774  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4823  hypothetical protein  28.17 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000842276  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1900  hypothetical protein  30.07 
 
 
207 aa  41.6  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>