19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14460 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14460  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0121  hypothetical protein  36 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0298502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0267  hypothetical protein  37.8 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.202879  normal  0.132358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3204  hypothetical protein  36 
 
 		 220 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20809  unclonable  0.0000000000140296 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1385  hypothetical protein  40.98 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107247  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12250  hypothetical protein  34.12 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0084  hypothetical protein  36.67 
 
 		 217 aa  89.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0045  hypothetical protein  35.32 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0784  hypothetical protein  27.57 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4823  hypothetical protein  32.39 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000842276  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2047  hypothetical protein  33.04 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0801598  normal  0.340354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0401  hypothetical protein  28.7 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5845  hypothetical protein  28.29 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1965  hypothetical protein  31.58 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4669  hypothetical protein  29.82 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67545  predicted protein  24.29 
 
 		 348 aa  44.7  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.301787 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05705  Golgi phosphoprotein 3 (GPP34) domain containing protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06630)  26.47 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5198  hypothetical protein  31.82 
 
 		 275 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0646774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0430  hypothetical protein  31.77 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.119408 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>