21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0121 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0121  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0298502  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0045  hypothetical protein  64.06 
 
 
218 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0084  hypothetical protein  42.65 
 
 
217 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0784  hypothetical protein  36.02 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12250  hypothetical protein  38.5 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3204  hypothetical protein  36.6 
 
 
220 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20809  unclonable  0.0000000000140296 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14460  hypothetical protein  36.15 
 
 
226 aa  101  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0267  hypothetical protein  32.06 
 
 
238 aa  87  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.202879  normal  0.132358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0401  hypothetical protein  32.74 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1385  hypothetical protein  34.8 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107247  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3619  hypothetical protein  28.26 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5845  hypothetical protein  33.14 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4823  hypothetical protein  31.52 
 
 
242 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000842276  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3587  hypothetical protein  26.79 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0430  hypothetical protein  30.89 
 
 
227 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.119408 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3324  hypothetical protein  30.56 
 
 
241 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05705  Golgi phosphoprotein 3 (GPP34) domain containing protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06630)  27.88 
 
 
353 aa  51.6  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02330  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  27.64 
 
 
386 aa  49.7  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5815  hypothetical protein  28.14 
 
 
215 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67545  predicted protein  26.22 
 
 
348 aa  47  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.301787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1900  hypothetical protein  29.71 
 
 
207 aa  42  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>