13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12250 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_12250  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  437  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0121  hypothetical protein  38.5 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0298502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0267  hypothetical protein  35.89 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.202879  normal  0.132358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0084  hypothetical protein  35.58 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0045  hypothetical protein  36.1 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14460  hypothetical protein  34.12 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1385  hypothetical protein  39.22 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3204  hypothetical protein  33.5 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20809  unclonable  0.0000000000140296 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0784  hypothetical protein  27.57 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4823  hypothetical protein  34.07 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000842276  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0401  hypothetical protein  32.74 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0430  hypothetical protein  31.55 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.119408 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67545  predicted protein  26.51 
 
 		 348 aa  42  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.301787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>