21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0084 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0084  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0121  hypothetical protein  41.44 
 
 		 219 aa  147  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0298502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3204  hypothetical protein  41.71 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20809  unclonable  0.0000000000140296 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0045  hypothetical protein  44.67 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5845  hypothetical protein  36.67 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14460  hypothetical protein  38.07 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12250  hypothetical protein  36.79 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0401  hypothetical protein  33.68 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4823  hypothetical protein  33.52 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000842276  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0784  hypothetical protein  29.67 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0267  hypothetical protein  30.99 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.202879  normal  0.132358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1385  hypothetical protein  32.56 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107247  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3587  hypothetical protein  27.51 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3619  hypothetical protein  31.65 
 
 		 257 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05705  Golgi phosphoprotein 3 (GPP34) domain containing protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06630)  26.85 
 
 		 353 aa  48.9  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5815  hypothetical protein  33.94 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3324  hypothetical protein  28.95 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67545  predicted protein  25.33 
 
 		 348 aa  45.4  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.301787 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02330  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  27.89 
 
 		 386 aa  45.4  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0430  hypothetical protein  28.72 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.119408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4019  hypothetical protein  31.62 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393141  decreased coverage  0.000309132 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>