More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6272 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_6272  transposase IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
305 aa  613  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.407349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2112  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.65 
 
 
325 aa  252  6e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.838809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0045  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.27 
 
 
318 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0046  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.27 
 
 
318 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0094  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.27 
 
 
318 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.05206  hitchhiker  0.00363531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0132  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.27 
 
 
318 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0760311  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0488  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.27 
 
 
318 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0670  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.27 
 
 
318 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.375238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0723  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.27 
 
 
318 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120706  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0958  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.27 
 
 
318 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1143  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.27 
 
 
318 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1718  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.27 
 
 
318 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00396754  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2073  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.27 
 
 
318 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000159022  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2810  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.27 
 
 
318 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2975  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.27 
 
 
318 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3429  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.27 
 
 
318 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.96 
 
 
314 aa  162  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3427  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.96 
 
 
314 aa  162  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.934881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.65 
 
 
314 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1602  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.65 
 
 
314 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4428  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.85 
 
 
326 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0327166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0271  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.85 
 
 
326 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.982036  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7776  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.85 
 
 
326 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1618  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.85 
 
 
326 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119532  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4772  transposase IS111A/IS1328/IS1533  37.82 
 
 
326 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0687  transposase IS111A/IS1328/IS1533  37.82 
 
 
326 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204727  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1833  transposase IS111A/IS1328/IS1533  37.82 
 
 
326 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3615  transposase IS111A/IS1328/IS1533  37.82 
 
 
326 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.457809  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2773  transposase IS111A/IS1328/IS1533  37.82 
 
 
326 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1663  transposase IS111A/IS1328/IS1533  37.82 
 
 
326 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5245  transposase IS111A/IS1328/IS1533  37.82 
 
 
326 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5427  transposase IS111A/IS1328/IS1533  37.82 
 
 
326 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1548  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.89 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3686  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.89 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.57 
 
 
309 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.57 
 
 
309 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.98 
 
 
316 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5809  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.02 
 
 
321 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  hitchhiker  0.000316639 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3523  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.02 
 
 
321 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3440  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.02 
 
 
321 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.830328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4107  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.02 
 
 
321 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190664  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2238  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.02 
 
 
321 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0133  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.93 
 
 
315 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2664  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.93 
 
 
315 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219726  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2708  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.93 
 
 
315 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2316  transposase IS110 family protein  37.42 
 
 
315 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367866  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2742  ISCps7, transposase  31.21 
 
 
317 aa  143  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.102652  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2339  transposase IS110 family protein  41.74 
 
 
315 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.354991 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0668  transposase IS110 family protein  41.74 
 
 
315 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.732525  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0821  transposase IS110 family protein  41.74 
 
 
315 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450951  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1817  transposase IS116/IS110/IS902  35.53 
 
 
321 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2208  transposase IS116/IS110/IS902  35.53 
 
 
321 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.53 
 
 
321 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.53 
 
 
321 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4857  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.53 
 
 
321 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131589  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.18 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0645698  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0043  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.18 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0856  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.47 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3420  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.71 
 
 
322 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.415822  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4991  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.86 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3883  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.86 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.18 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.945374 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1046  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.86 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1261  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.86 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.812718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1426  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.86 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0372411  normal  0.895779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2597  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.86 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2517  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.33 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1149  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.75 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.852696  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1423  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.75 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0743274  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1739  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.75 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.106448  normal  0.0290423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2894  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.75 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.940801  normal  0.95279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2923  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.75 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.75 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.311525  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0519  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.2 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.2 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.2 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.2 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.909049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.2 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206363  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4601  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.2 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3708  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.29 
 
 
319 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1084  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.28 
 
 
312 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0840793  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2936  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.28 
 
 
312 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4670  transposase IS110 family protein  40.91 
 
 
315 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.467325 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0284  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.21 
 
 
316 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0292  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.21 
 
 
316 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.21 
 
 
316 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.787142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.21 
 
 
316 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0348953  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3185  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.21 
 
 
316 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3800  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.21 
 
 
316 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.834348  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4407  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.21 
 
 
316 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.497846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4477  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.21 
 
 
316 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2164  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.28 
 
 
312 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0243723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.28 
 
 
312 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2924  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.28 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.690618 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.28 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.778833  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.28 
 
 
312 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573271  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2763  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.21 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0660856  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0388  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.94 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5211  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.6 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313194  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3496  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.94 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.118492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>