More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2742 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2742  ISCps7, transposase  100 
 
 
317 aa  652    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.102652  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0388  transposase IS111A/IS1328/IS1533  69.97 
 
 
318 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2289  transposase IS111A/IS1328/IS1533  69.97 
 
 
318 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.795414  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3496  transposase IS111A/IS1328/IS1533  69.97 
 
 
318 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.118492 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1134  transposase IS116/IS110/IS902  67.09 
 
 
323 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0840  transposase IS116/IS110/IS902  68.05 
 
 
318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0862  transposase IS116/IS110/IS902  68.05 
 
 
318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.595658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1845  transposase IS116/IS110/IS902  68.05 
 
 
318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1950  transposase IS116/IS110/IS902  68.05 
 
 
318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0873071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2653  transposase IS116/IS110/IS902  68.05 
 
 
318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3756  transposase IS116/IS110/IS902  68.05 
 
 
318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.723193  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1384  transposase IS116/IS110/IS902  67.14 
 
 
213 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0045  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.83 
 
 
318 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0046  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.83 
 
 
318 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0094  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.83 
 
 
318 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.05206  hitchhiker  0.00363531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0132  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.83 
 
 
318 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0760311  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0488  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.83 
 
 
318 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0670  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.83 
 
 
318 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.375238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0723  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.83 
 
 
318 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120706  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0958  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.83 
 
 
318 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1143  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.83 
 
 
318 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1718  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.83 
 
 
318 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00396754  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2073  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.83 
 
 
318 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000159022  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2810  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.83 
 
 
318 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2975  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.83 
 
 
318 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3429  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  41.83 
 
 
318 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1548  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.94 
 
 
309 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3686  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.94 
 
 
309 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.61 
 
 
309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.61 
 
 
309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1602  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.19 
 
 
314 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.19 
 
 
314 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3427  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.19 
 
 
314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.934881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.19 
 
 
314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2517  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.1 
 
 
322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3420  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.78 
 
 
322 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.415822  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8696  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.74 
 
 
315 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1179  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.74 
 
 
315 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5832  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.74 
 
 
315 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236486  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4794  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.74 
 
 
315 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7866  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.74 
 
 
315 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0133  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.99 
 
 
315 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2664  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.99 
 
 
315 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219726  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2708  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.99 
 
 
315 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0668  transposase IS110 family protein  40.4 
 
 
315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.732525  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0821  transposase IS110 family protein  40.4 
 
 
315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450951  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2316  transposase IS110 family protein  40.4 
 
 
315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367866  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4670  transposase IS110 family protein  39.93 
 
 
315 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.467325 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0519  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.22 
 
 
320 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.22 
 
 
320 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.22 
 
 
320 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.22 
 
 
320 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.909049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.22 
 
 
320 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206363  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4601  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.22 
 
 
320 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1149  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.99 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.852696  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1423  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.99 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0743274  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1739  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.99 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.106448  normal  0.0290423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2894  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.99 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.940801  normal  0.95279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2923  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.99 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.99 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.311525  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2339  transposase IS110 family protein  40.07 
 
 
315 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.354991 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.7 
 
 
316 aa  215  8e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5809  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.59 
 
 
321 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  hitchhiker  0.000316639 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3440  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.28 
 
 
321 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.830328 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2238  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.28 
 
 
321 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4107  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.28 
 
 
321 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190664  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3523  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.28 
 
 
321 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0067  IS110 family transposase  37.99 
 
 
323 aa  209  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0110214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2558  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.08 
 
 
320 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3309  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.08 
 
 
320 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.42 
 
 
321 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.945374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0925  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.08 
 
 
320 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94053  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0043  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.42 
 
 
321 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.42 
 
 
321 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0645698  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2915  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  33.76 
 
 
320 aa  202  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3125  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  33.76 
 
 
320 aa  202  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618983  unclonable  0.000014067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4857  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.11 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131589  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.11 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1817  transposase IS116/IS110/IS902  35.11 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2208  transposase IS116/IS110/IS902  35.11 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.11 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1046  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  35.86 
 
 
316 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1261  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  35.86 
 
 
316 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.812718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1426  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  35.86 
 
 
316 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0372411  normal  0.895779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2597  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  35.86 
 
 
316 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3883  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  35.86 
 
 
316 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4991  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  35.86 
 
 
316 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02575  hypothetical protein  67.41 
 
 
147 aa  198  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1041  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.71 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4455  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.71 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0856  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.62 
 
 
318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0619  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.71 
 
 
320 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0564215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2843  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.39 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1204  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.71 
 
 
320 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.89173  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1511  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.39 
 
 
320 aa  195  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0532296 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3803  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.39 
 
 
320 aa  195  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0072  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.39 
 
 
320 aa  195  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413963  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0788  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.71 
 
 
320 aa  195  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2280  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.39 
 
 
320 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2112  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.39 
 
 
325 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.838809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>