More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4991 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1046  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
316 aa  641    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1261  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
316 aa  641    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.812718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1426  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
316 aa  641    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0372411  normal  0.895779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2597  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
316 aa  641    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3883  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
316 aa  641    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4991  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 
316 aa  641    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4131  IS111A/IS1328/IS1533  44.44 
 
 
309 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0485642  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3420  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.48 
 
 
322 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.415822  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2517  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.16 
 
 
322 aa  215  8e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1149  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.44 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.852696  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1423  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.44 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0743274  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1739  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.44 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.106448  normal  0.0290423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2894  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.44 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.940801  normal  0.95279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2923  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.44 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.44 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.311525  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0043  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.18 
 
 
321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.18 
 
 
321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0645698  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.18 
 
 
321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.945374 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.18 
 
 
321 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1817  transposase IS116/IS110/IS902  41.18 
 
 
321 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2208  transposase IS116/IS110/IS902  41.18 
 
 
321 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.18 
 
 
321 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0519  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.44 
 
 
320 aa  212  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.44 
 
 
320 aa  212  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.44 
 
 
320 aa  212  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.44 
 
 
320 aa  212  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.909049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.44 
 
 
320 aa  212  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206363  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4601  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.44 
 
 
320 aa  212  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4857  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.18 
 
 
321 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131589  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0045  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  40.52 
 
 
318 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0046  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  40.52 
 
 
318 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0094  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  40.52 
 
 
318 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.05206  hitchhiker  0.00363531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0132  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  40.52 
 
 
318 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0760311  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0488  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  40.52 
 
 
318 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0670  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  40.52 
 
 
318 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.375238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0723  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  40.52 
 
 
318 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120706  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0958  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  40.52 
 
 
318 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1143  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  40.52 
 
 
318 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1718  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  40.52 
 
 
318 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00396754  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2073  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  40.52 
 
 
318 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000159022  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2810  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  40.52 
 
 
318 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2975  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  40.52 
 
 
318 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3429  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  40.52 
 
 
318 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0856  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.39 
 
 
318 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0654  transposase IS116/IS110/IS902  41.42 
 
 
328 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3340  transposase IS116/IS110/IS902  41.42 
 
 
328 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451558  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0067  IS110 family transposase  40.45 
 
 
323 aa  205  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0110214 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5809  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.75 
 
 
321 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  hitchhiker  0.000316639 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.85 
 
 
316 aa  202  8e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3523  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.42 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3440  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.42 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.830328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4107  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.42 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190664  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2238  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.42 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2289  transposase IS111A/IS1328/IS1533  36.96 
 
 
318 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.795414  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0388  transposase IS111A/IS1328/IS1533  36.96 
 
 
318 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3496  transposase IS111A/IS1328/IS1533  36.96 
 
 
318 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.118492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2742  ISCps7, transposase  35.86 
 
 
317 aa  200  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.102652  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0479  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.71 
 
 
304 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.5616  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2112  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.76 
 
 
325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.838809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0634  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.52 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1115  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.52 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.840923  normal  0.908147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1394  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.52 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164924  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1512  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.52 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.364896  normal  0.249942 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1946  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.52 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0175494  decreased coverage  0.00353589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2020  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.52 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00925904  normal  0.0355962 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2502  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.52 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  0.030374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2605  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.52 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.978061  normal  0.958241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3229  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.52 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4264  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.52 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4084  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.2 
 
 
316 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3822  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.2 
 
 
316 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357564  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2708  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.98 
 
 
315 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0133  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.98 
 
 
315 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2664  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.98 
 
 
315 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219726  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0840  transposase IS116/IS110/IS902  35.86 
 
 
318 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0862  transposase IS116/IS110/IS902  35.86 
 
 
318 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.595658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1845  transposase IS116/IS110/IS902  35.86 
 
 
318 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1950  transposase IS116/IS110/IS902  35.86 
 
 
318 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0873071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2653  transposase IS116/IS110/IS902  35.86 
 
 
318 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3756  transposase IS116/IS110/IS902  35.86 
 
 
318 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.723193  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1179  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.02 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7866  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.02 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8696  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.02 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5832  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.02 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236486  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4794  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.02 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0284  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.47 
 
 
316 aa  188  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0292  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.47 
 
 
316 aa  188  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.47 
 
 
316 aa  188  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.787142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.47 
 
 
316 aa  188  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0348953  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3185  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.47 
 
 
316 aa  188  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3800  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.47 
 
 
316 aa  188  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.834348  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4477  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.47 
 
 
316 aa  188  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.41 
 
 
314 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1602  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.41 
 
 
314 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.41 
 
 
314 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3427  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.41 
 
 
314 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.934881 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4407  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.47 
 
 
316 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.497846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2763  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.82 
 
 
316 aa  185  9e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0660856  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.83 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0987071  normal  0.815394 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1134  transposase IS116/IS110/IS902  35.2 
 
 
323 aa  183  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>