23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5947 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5947    100 
 
 		 1382 bp  2740    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123612 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5124  IS4 family transposase  82.59 
 
 		 1374 bp  113  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4905  IS4 family transposase  82.59 
 
 		 1374 bp  113  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2767  IS4 family transposase  82.59 
 
 		 1374 bp  113  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3050  IS4 family transposase  82.59 
 
 		 1374 bp  113  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000789979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6639  transposase IS4 family protein  86.92 
 
 		 1383 bp  101  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4639  transposase IS4 family protein  86.92 
 
 		 1383 bp  101  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4611  transposase IS4 family protein  86.92 
 
 		 1383 bp  101  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.239615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3346  transposase IS4 family protein  86.92 
 
 		 1383 bp  101  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3057  transposase IS4 family protein  86.92 
 
 		 1383 bp  101  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0927  transposase IS4 family protein  86.92 
 
 		 1383 bp  101  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8073  transposase IS4 family protein  86.92 
 
 		 1383 bp  101  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6370    82.84 
 
 		 1374 bp  97.6  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0818  transposase and inactivated derivative  85.71 
 
 		 675 bp  89.7  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149498  hitchhiker  0.00134243 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8305    82.17 
 
 		 1350 bp  81.8  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8413    82.17 
 
 		 1353 bp  81.8  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8430    82.17 
 
 		 1348 bp  81.8  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  80.5 
 
 		 1377 bp  79.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3223  transposase, IS4 family protein  95.45 
 
 		 1383 bp  71.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4079  transposase IS4 family protein  85.51 
 
 		 1383 bp  58  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0888192 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3878  transposase IS4 family protein  85.51 
 
 		 1383 bp  58  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.726843 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3682  transposase IS4 family protein  85.51 
 
 		 1383 bp  58  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.399219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3215  hypothetical protein  90.24 
 
 		 441 bp  50.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.641327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>