More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3341 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3341  purine nucleoside phosphorylase  100 
 
 
265 aa  520  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.623728 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4175  purine nucleoside phosphorylase  73.38 
 
 
266 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4463  purine nucleoside phosphorylase  72.24 
 
 
266 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316859  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0263  purine nucleoside phosphorylase  69.06 
 
 
269 aa  363  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3656  purine nucleoside phosphorylase  63.98 
 
 
268 aa  332  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0524  purine nucleoside phosphorylase  60.7 
 
 
267 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1622  purine nucleoside phosphorylase  61.78 
 
 
274 aa  271  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760163  normal  0.333036 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2286  purine nucleoside phosphorylase  62.62 
 
 
266 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.667426  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2966  purine nucleoside phosphorylase  59.57 
 
 
270 aa  267  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0249525  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3148  purine nucleoside phosphorylase  59.15 
 
 
274 aa  263  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2207  purine nucleoside phosphorylase  61.11 
 
 
266 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.672659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0882  purine nucleoside phosphorylase  60.65 
 
 
266 aa  262  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.463145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0509  purine nucleoside phosphorylase  56.1 
 
 
286 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3925  purine nucleoside phosphorylase  54.32 
 
 
274 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.860697  normal  0.9635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3192  purine nucleoside phosphorylase  58.26 
 
 
270 aa  248  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  0.600967 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2818  purine nucleoside phosphorylase  48.59 
 
 
272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0139  purine nucleoside phosphorylase  49.4 
 
 
273 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2187  purine nucleoside phosphorylase  49.4 
 
 
273 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.710822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4255  purine nucleoside phosphorylase  44.7 
 
 
285 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2785  purine nucleoside phosphorylase  43.98 
 
 
273 aa  229  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000440392  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2824  purine nucleoside phosphorylase  43.18 
 
 
287 aa  228  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2911  purine nucleoside phosphorylase  43.18 
 
 
287 aa  228  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0369  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
275 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2504  purine nucleoside phosphorylase  47.79 
 
 
272 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3827  purine nucleoside phosphorylase  42.86 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4219  purine nucleoside phosphorylase  42.86 
 
 
273 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000140945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4155  purine nucleoside phosphorylase  42.86 
 
 
273 aa  219  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.127782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3996  purine nucleoside phosphorylase  42.86 
 
 
273 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.687151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3843  purine nucleoside phosphorylase  42.86 
 
 
273 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4308  purine nucleoside phosphorylase  42.86 
 
 
273 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0248075  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4110  purine nucleoside phosphorylase  42.86 
 
 
273 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.82826e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4196  purine nucleoside phosphorylase  42.86 
 
 
273 aa  219  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00267818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1041  purine nucleoside phosphorylase  42.86 
 
 
273 aa  219  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00686248  hitchhiker  0.0000807252 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3917  purine nucleoside phosphorylase  42.86 
 
 
273 aa  218  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255669  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2255  purine nucleoside phosphorylase  46.13 
 
 
280 aa  218  7e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0664  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  44.98 
 
 
279 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693658  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1607  purine nucleoside phosphorylase  41.6 
 
 
279 aa  217  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1389  purine nucleoside phosphorylase  41.6 
 
 
279 aa  217  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1772  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  42.8 
 
 
272 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2566  purine nucleoside phosphorylase  47.48 
 
 
277 aa  214  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000084097  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2681  purine nucleoside phosphorylase  47.48 
 
 
277 aa  214  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2787  purine nucleoside phosphorylase  47.48 
 
 
277 aa  214  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245925  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2657  purine nucleoside phosphorylase  47.48 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.037583  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0852  purine nucleoside phosphorylase  43.23 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1783  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  43.41 
 
 
272 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1032  purine nucleoside phosphorylase  45.66 
 
 
299 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2934  purine nucleoside phosphorylase  43.41 
 
 
274 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  0.104404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1163  purine nucleoside phosphorylase  47.13 
 
 
287 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1088  purine nucleoside phosphorylase  45.83 
 
 
278 aa  210  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2615  purine nucleoside phosphorylase  46.64 
 
 
277 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1255  xanthosine phosphorylase  43.5 
 
 
277 aa  208  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00111174  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1537  purine nucleoside phosphorylase  46.59 
 
 
276 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.278191  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1666  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  41.73 
 
 
271 aa  206  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.0366177 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1022  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  45.91 
 
 
276 aa  205  5e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0711596  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2561  purine nucleoside phosphorylase  43.09 
 
 
277 aa  205  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0152176  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001956  purine nucleoside phosphorylase  41.89 
 
 
274 aa  205  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0663  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  47.17 
 
 
282 aa  204  9e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0601397  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1995  purine nucleoside phosphorylase  43.25 
 
 
274 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  decreased coverage  0.000000235429 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0373  purine nucleoside phosphorylase  43.56 
 
 
278 aa  204  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0652  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  43.01 
 
 
282 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3084  purine nucleoside phosphorylase  42.52 
 
 
275 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1201  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  41.22 
 
 
275 aa  202  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.202694  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0777  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  42.31 
 
 
275 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3075  purine nucleoside phosphorylase  42.52 
 
 
275 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1012  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  45.82 
 
 
275 aa  201  8e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3055  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  45.9 
 
 
280 aa  201  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.089752  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0652  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  42.65 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3227  purine nucleoside phosphorylase  42.13 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1292  purine nucleoside phosphorylase  42.13 
 
 
275 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.64922 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0606  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  39.92 
 
 
274 aa  198  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1718  purine nucleoside phosphorylase  41.9 
 
 
277 aa  198  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0618  inosine, guanosine, xanthosine phosphorylase  43.01 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1075  purine nucleoside phosphorylase  43.08 
 
 
269 aa  196  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1180  purine nucleoside phosphorylase  41.76 
 
 
269 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1371  purine nucleoside phosphorylase  41.38 
 
 
275 aa  194  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.584924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3448  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  43.83 
 
 
277 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1655  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  42.13 
 
 
288 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441226  hitchhiker  0.00385339 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08880  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  44.98 
 
 
284 aa  193  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00712876  normal  0.676601 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2032  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  40.87 
 
 
286 aa  192  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1299  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  47.03 
 
 
297 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0760  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  42.28 
 
 
272 aa  192  6e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06960  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  43.07 
 
 
270 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1936  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  39.1 
 
 
275 aa  191  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0320  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  41.89 
 
 
278 aa  189  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6092  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  40.84 
 
 
275 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0386  purine nucleoside phosphorylase  39.02 
 
 
272 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.867141  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0821  purine nucleoside phosphorylase  43.61 
 
 
281 aa  188  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834093 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1011  purine nucleoside phosphorylase  43.2 
 
 
274 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0762  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  43.25 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.831792  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1196  purine nucleoside phosphorylase  43.7 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0130681  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1259  purine nucleoside phosphorylase  42.86 
 
 
264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0264  purine nucleoside phosphorylase  38.61 
 
 
267 aa  183  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1526  purine nucleoside phosphorylase  40.16 
 
 
265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6601  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  39.39 
 
 
273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326925  normal  0.558296 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2166  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  43.17 
 
 
289 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.342229  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2216  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  37.9 
 
 
275 aa  175  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1244  purine nucleoside phosphorylase  43.3 
 
 
283 aa  175  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1261  purine nucleoside phosphorylase  43.3 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.531901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0646  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  37.45 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0461  purine nucleoside phosphorylase  41.57 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>