293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1995 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1995  purine nucleoside phosphorylase  100 
 
 		 274 aa  566  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  decreased coverage  0.000000235429 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001956  purine nucleoside phosphorylase  79.2 
 
 		 274 aa  454  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3084  purine nucleoside phosphorylase  80.29 
 
 		 275 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3075  purine nucleoside phosphorylase  80.66 
 
 		 275 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1292  purine nucleoside phosphorylase  80.29 
 
 		 275 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.64922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3227  purine nucleoside phosphorylase  79.93 
 
 		 275 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1718  purine nucleoside phosphorylase  78.28 
 
 		 277 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1255  xanthosine phosphorylase  67.83 
 
 		 277 aa  359  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00111174  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2911  purine nucleoside phosphorylase  64.15 
 
 		 287 aa  357  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2824  purine nucleoside phosphorylase  64.15 
 
 		 287 aa  357  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2561  purine nucleoside phosphorylase  66.67 
 
 		 277 aa  353  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0152176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2934  purine nucleoside phosphorylase  65.89 
 
 		 274 aa  352  4e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  0.104404 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2657  purine nucleoside phosphorylase  67.83 
 
 		 277 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.037583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2566  purine nucleoside phosphorylase  67.44 
 
 		 277 aa  351  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000084097  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2681  purine nucleoside phosphorylase  67.44 
 
 		 277 aa  351  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2787  purine nucleoside phosphorylase  67.05 
 
 		 277 aa  351  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2615  purine nucleoside phosphorylase  67.05 
 
 		 277 aa  350  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4255  purine nucleoside phosphorylase  61.66 
 
 		 285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1163  purine nucleoside phosphorylase  53.33 
 
 		 287 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2187  purine nucleoside phosphorylase  46.13 
 
 		 273 aa  256  3e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.710822  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0139  purine nucleoside phosphorylase  46.13 
 
 		 273 aa  256  3e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1607  purine nucleoside phosphorylase  48.25 
 
 		 279 aa  256  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1389  purine nucleoside phosphorylase  47.86 
 
 		 279 aa  254  8e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0369  purine nucleoside phosphorylase  47.06 
 
 		 275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2785  purine nucleoside phosphorylase  46.86 
 
 		 273 aa  246  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000440392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2255  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 		 280 aa  244  8e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3917  purine nucleoside phosphorylase  47.1 
 
 		 273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3827  purine nucleoside phosphorylase  47.1 
 
 		 273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4155  purine nucleoside phosphorylase  47.1 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.127782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3996  purine nucleoside phosphorylase  47.1 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.687151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3843  purine nucleoside phosphorylase  47.1 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652897  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1041  purine nucleoside phosphorylase  47.1 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00686248  hitchhiker  0.0000807252 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4196  purine nucleoside phosphorylase  47.1 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4308  purine nucleoside phosphorylase  47.1 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0248075  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4110  purine nucleoside phosphorylase  47.1 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.82826e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4219  purine nucleoside phosphorylase  47.1 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000140945  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1783  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  46.1 
 
 		 272 aa  239  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0852  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 		 273 aa  236  3e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3448  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  46.06 
 
 		 277 aa  236  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2818  purine nucleoside phosphorylase  45.2 
 
 		 272 aa  236  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3055  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  43.6 
 
 		 280 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.089752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0646  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  44.14 
 
 		 271 aa  222  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0373  purine nucleoside phosphorylase  48.72 
 
 		 278 aa  221  8e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2504  purine nucleoside phosphorylase  45.6 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138401  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1180  purine nucleoside phosphorylase  43.6 
 
 		 269 aa  219  5e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1201  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  44.8 
 
 		 275 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.202694  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1075  purine nucleoside phosphorylase  44.44 
 
 		 269 aa  216  4e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1371  purine nucleoside phosphorylase  45.24 
 
 		 275 aa  215  7e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.584924  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1666  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  44.22 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.0366177 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1032  purine nucleoside phosphorylase  47.79 
 
 		 299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1088  purine nucleoside phosphorylase  47.79 
 
 		 278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1772  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  41.83 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2216  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  46.55 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1936  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  40.81 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0386  purine nucleoside phosphorylase  40.47 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.867141  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06960  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  45.74 
 
 		 270 aa  210  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4175  purine nucleoside phosphorylase  43.63 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0606  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  41.8 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6601  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  45.6 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326925  normal  0.558296 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3341  purine nucleoside phosphorylase  43.25 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.623728 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4463  purine nucleoside phosphorylase  43.24 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316859  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1022  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  40.82 
 
 		 276 aa  204  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0711596  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0777  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  41.46 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1299  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  43.54 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3656  purine nucleoside phosphorylase  44 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1655  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  41.83 
 
 		 288 aa  198  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441226  hitchhiker  0.00385339 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0524  purine nucleoside phosphorylase  43.43 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0663  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  41.35 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0601397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1703  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  38.81 
 
 		 273 aa  195  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.423097  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0762  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  41.51 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.831792  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2264  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  38.43 
 
 		 275 aa  192  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2166  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  43.29 
 
 		 289 aa  191  8e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.342229  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1259  purine nucleoside phosphorylase  41.2 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2286  purine nucleoside phosphorylase  46.82 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.667426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1526  purine nucleoside phosphorylase  39.59 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6092  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  38.98 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0664  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  40.82 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693658  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1351  purine nucleoside phosphorylase  39.03 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0263  purine nucleoside phosphorylase  41.43 
 
 		 269 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2032  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  37.89 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0652  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  39.61 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2710  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  40.73 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00787639  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0264  purine nucleoside phosphorylase  39.36 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0618  inosine, guanosine, xanthosine phosphorylase  40 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1196  purine nucleoside phosphorylase  40 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0130681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0652  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  39.61 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0477  purine nucleoside phosphorylase  39.6 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2966  purine nucleoside phosphorylase  39.47 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0249525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0821  purine nucleoside phosphorylase  39.68 
 
 		 281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834093 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0630  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  38.55 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3148  purine nucleoside phosphorylase  40.24 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1804  purine nucleoside phosphorylase  39.11 
 
 		 273 aa  181  9.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2962  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  42.67 
 
 		 273 aa  181  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1012  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  38.89 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2207  purine nucleoside phosphorylase  45.45 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.672659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0320  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  38.13 
 
 		 278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3943  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  43.24 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.473265 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0882  purine nucleoside phosphorylase  45 
 
 		 266 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463145 
 
 
-
 
NC_002950  PG0558  purine nucleoside phosphorylase  42.63 
 
 		 273 aa  178  7e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0760  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  41.96 
 
 		 272 aa  178  7e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>