295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1201 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1201  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  100 
 
 
275 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.202694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3917  purine nucleoside phosphorylase  57.74 
 
 
273 aa  338  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255669  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4155  purine nucleoside phosphorylase  57.36 
 
 
273 aa  334  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.127782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3996  purine nucleoside phosphorylase  57.36 
 
 
273 aa  334  7.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.687151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3843  purine nucleoside phosphorylase  57.36 
 
 
273 aa  334  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4308  purine nucleoside phosphorylase  57.36 
 
 
273 aa  334  7.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0248075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1041  purine nucleoside phosphorylase  57.36 
 
 
273 aa  334  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00686248  hitchhiker  0.0000807252 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4219  purine nucleoside phosphorylase  57.36 
 
 
273 aa  334  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000140945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4196  purine nucleoside phosphorylase  57.36 
 
 
273 aa  334  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00267818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4110  purine nucleoside phosphorylase  57.36 
 
 
273 aa  334  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.82826e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3827  purine nucleoside phosphorylase  56.98 
 
 
273 aa  332  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2785  purine nucleoside phosphorylase  56.23 
 
 
273 aa  328  4e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000440392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2255  purine nucleoside phosphorylase  56.87 
 
 
280 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0369  purine nucleoside phosphorylase  57.25 
 
 
275 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2818  purine nucleoside phosphorylase  52.61 
 
 
272 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1666  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  55.06 
 
 
271 aa  310  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.0366177 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1772  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  54.48 
 
 
272 aa  309  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06960  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  56.55 
 
 
270 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3448  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  53.21 
 
 
277 aa  300  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2504  purine nucleoside phosphorylase  52.61 
 
 
272 aa  295  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138401  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1075  purine nucleoside phosphorylase  53.9 
 
 
269 aa  290  2e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1936  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  50.55 
 
 
275 aa  285  4e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1783  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  48.69 
 
 
272 aa  276  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0606  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  48.89 
 
 
274 aa  272  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0760  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  52.46 
 
 
272 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1526  purine nucleoside phosphorylase  49.81 
 
 
265 aa  269  4e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2032  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  46.62 
 
 
286 aa  265  7e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1180  purine nucleoside phosphorylase  48.33 
 
 
269 aa  263  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1032  purine nucleoside phosphorylase  47.39 
 
 
299 aa  263  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1088  purine nucleoside phosphorylase  47.39 
 
 
278 aa  263  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0264  purine nucleoside phosphorylase  47.21 
 
 
267 aa  263  3e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0702  purine nucleoside phosphorylase  47.92 
 
 
273 aa  262  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0777  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  44.44 
 
 
275 aa  262  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1782  purine nucleoside phosphorylase  47.73 
 
 
273 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.559182  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0373  purine nucleoside phosphorylase  47.17 
 
 
278 aa  256  2e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1804  purine nucleoside phosphorylase  46.42 
 
 
273 aa  256  3e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6092  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  46.88 
 
 
275 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0646  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  45.39 
 
 
271 aa  256  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1259  purine nucleoside phosphorylase  46.64 
 
 
264 aa  255  5e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0477  purine nucleoside phosphorylase  47.17 
 
 
302 aa  255  7e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1661  purine nucleoside phosphorylase  46.99 
 
 
273 aa  255  7e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0852  purine nucleoside phosphorylase  44.81 
 
 
273 aa  253  3e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1022  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  45.59 
 
 
276 aa  250  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0711596  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1196  purine nucleoside phosphorylase  46.3 
 
 
265 aa  249  3e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0130681  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0386  purine nucleoside phosphorylase  45.39 
 
 
272 aa  249  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.867141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6601  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  45.22 
 
 
273 aa  249  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326925  normal  0.558296 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1351  purine nucleoside phosphorylase  44.91 
 
 
273 aa  248  6e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2072  purine nucleoside phosphorylase  44.91 
 
 
273 aa  246  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0664  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  46.33 
 
 
279 aa  246  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693658  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0558  purine nucleoside phosphorylase  48.31 
 
 
273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1655  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  44 
 
 
288 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441226  hitchhiker  0.00385339 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3055  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  44.36 
 
 
280 aa  242  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.089752  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2166  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  48.26 
 
 
289 aa  240  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.342229  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1371  purine nucleoside phosphorylase  43.45 
 
 
275 aa  239  4e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.584924  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2264  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  42.75 
 
 
275 aa  239  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1703  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  43.91 
 
 
273 aa  238  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.423097  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2216  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  40.37 
 
 
275 aa  238  5e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3943  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  43.66 
 
 
271 aa  237  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.473265 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0573  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  46.13 
 
 
270 aa  236  4e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0618  inosine, guanosine, xanthosine phosphorylase  44.49 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0663  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  45.56 
 
 
282 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0601397  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4255  purine nucleoside phosphorylase  44.49 
 
 
285 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1299  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  45.88 
 
 
297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0652  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  43.35 
 
 
282 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0762  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  43.68 
 
 
272 aa  230  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.831792  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1012  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  47.41 
 
 
275 aa  230  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0652  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  42.97 
 
 
282 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06490  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific (AFU_orthologue; AFUA_6G05320)  42.72 
 
 
315 aa  229  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000000176508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2962  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  44.65 
 
 
273 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1011  purine nucleoside phosphorylase  44.24 
 
 
274 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1537  purine nucleoside phosphorylase  42.16 
 
 
276 aa  225  8e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.278191  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05020  purine nucleoside phosphorylase  41.98 
 
 
270 aa  224  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345167  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0630  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  41.13 
 
 
273 aa  221  8e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2824  purine nucleoside phosphorylase  44.49 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2911  purine nucleoside phosphorylase  44.49 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0821  purine nucleoside phosphorylase  45.97 
 
 
281 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834093 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1255  xanthosine phosphorylase  44.08 
 
 
277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00111174  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08880  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  42.91 
 
 
284 aa  218  6e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00712876  normal  0.676601 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0320  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  40 
 
 
278 aa  218  6e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2934  purine nucleoside phosphorylase  43.9 
 
 
274 aa  218  8.999999999999998e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  0.104404 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1995  purine nucleoside phosphorylase  44.8 
 
 
274 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  decreased coverage  0.000000235429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7245  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  42.01 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.236981  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2561  purine nucleoside phosphorylase  43.27 
 
 
277 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0152176  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3227  purine nucleoside phosphorylase  44.44 
 
 
275 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1718  purine nucleoside phosphorylase  44.27 
 
 
277 aa  215  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3075  purine nucleoside phosphorylase  44.05 
 
 
275 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1292  purine nucleoside phosphorylase  44.05 
 
 
275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.64922 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1889  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  42.35 
 
 
277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000110705 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1389  purine nucleoside phosphorylase  43.3 
 
 
279 aa  211  9e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1607  purine nucleoside phosphorylase  43.3 
 
 
279 aa  211  9e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001956  purine nucleoside phosphorylase  43.87 
 
 
274 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3084  purine nucleoside phosphorylase  43.65 
 
 
275 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2710  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  45.42 
 
 
281 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00787639  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2681  purine nucleoside phosphorylase  42.04 
 
 
277 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2566  purine nucleoside phosphorylase  42.04 
 
 
277 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000084097  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0263  purine nucleoside phosphorylase  42.8 
 
 
269 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2787  purine nucleoside phosphorylase  42.04 
 
 
277 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245925  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2657  purine nucleoside phosphorylase  42.04 
 
 
277 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.037583  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0139  purine nucleoside phosphorylase  43.82 
 
 
273 aa  208  7e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2187  purine nucleoside phosphorylase  43.82 
 
 
273 aa  208  7e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.710822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>