More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0263 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0263  purine nucleoside phosphorylase  100 
 
 
269 aa  533  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4175  purine nucleoside phosphorylase  73.56 
 
 
266 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4463  purine nucleoside phosphorylase  72.73 
 
 
266 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316859  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3341  purine nucleoside phosphorylase  69.06 
 
 
265 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.623728 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3656  purine nucleoside phosphorylase  66.79 
 
 
268 aa  359  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0524  purine nucleoside phosphorylase  60.08 
 
 
267 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2286  purine nucleoside phosphorylase  61.54 
 
 
266 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.667426  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1622  purine nucleoside phosphorylase  60 
 
 
274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760163  normal  0.333036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0509  purine nucleoside phosphorylase  55.06 
 
 
286 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2207  purine nucleoside phosphorylase  60.63 
 
 
266 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.672659  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3148  purine nucleoside phosphorylase  58.77 
 
 
274 aa  257  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0882  purine nucleoside phosphorylase  60.18 
 
 
266 aa  255  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.463145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2966  purine nucleoside phosphorylase  57.02 
 
 
270 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0249525  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3925  purine nucleoside phosphorylase  57.46 
 
 
274 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.860697  normal  0.9635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3192  purine nucleoside phosphorylase  54.32 
 
 
270 aa  232  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  0.600967 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2785  purine nucleoside phosphorylase  45.38 
 
 
273 aa  226  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000440392  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2818  purine nucleoside phosphorylase  44.35 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4155  purine nucleoside phosphorylase  44.35 
 
 
273 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.127782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3996  purine nucleoside phosphorylase  44.35 
 
 
273 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.687151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3827  purine nucleoside phosphorylase  44.35 
 
 
273 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3843  purine nucleoside phosphorylase  44.35 
 
 
273 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4308  purine nucleoside phosphorylase  44.35 
 
 
273 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0248075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4196  purine nucleoside phosphorylase  44.35 
 
 
273 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00267818  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4219  purine nucleoside phosphorylase  44.35 
 
 
273 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000140945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1041  purine nucleoside phosphorylase  44.35 
 
 
273 aa  216  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00686248  hitchhiker  0.0000807252 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3917  purine nucleoside phosphorylase  44.35 
 
 
273 aa  216  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4110  purine nucleoside phosphorylase  44.35 
 
 
273 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.82826e-41 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2187  purine nucleoside phosphorylase  46.34 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.710822  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0139  purine nucleoside phosphorylase  46.34 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1666  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  44.58 
 
 
271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.0366177 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2824  purine nucleoside phosphorylase  45.02 
 
 
287 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2911  purine nucleoside phosphorylase  45.02 
 
 
287 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0369  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
275 aa  214  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4255  purine nucleoside phosphorylase  42.15 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1201  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  42.8 
 
 
275 aa  209  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.202694  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1783  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  41.85 
 
 
272 aa  209  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1655  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  43.82 
 
 
288 aa  206  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441226  hitchhiker  0.00385339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2657  purine nucleoside phosphorylase  43.58 
 
 
277 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.037583  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6092  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  43.61 
 
 
275 aa  206  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2787  purine nucleoside phosphorylase  43.58 
 
 
277 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245925  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2681  purine nucleoside phosphorylase  43.19 
 
 
277 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2566  purine nucleoside phosphorylase  43.19 
 
 
277 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000084097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2934  purine nucleoside phosphorylase  46.12 
 
 
274 aa  205  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  0.104404 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2615  purine nucleoside phosphorylase  42.8 
 
 
277 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2255  purine nucleoside phosphorylase  44.79 
 
 
280 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1607  purine nucleoside phosphorylase  41.83 
 
 
279 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1255  xanthosine phosphorylase  42.02 
 
 
277 aa  202  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00111174  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2504  purine nucleoside phosphorylase  42.55 
 
 
272 aa  202  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138401  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1772  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  42.17 
 
 
272 aa  202  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1371  purine nucleoside phosphorylase  42.74 
 
 
275 aa  201  8e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.584924  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1389  purine nucleoside phosphorylase  41.43 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1012  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  47.58 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1299  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  48.72 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0852  purine nucleoside phosphorylase  42.53 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0777  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  42.52 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2561  purine nucleoside phosphorylase  42.02 
 
 
277 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0152176  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0664  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  44.72 
 
 
279 aa  198  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693658  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1032  purine nucleoside phosphorylase  43.51 
 
 
299 aa  198  7e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1088  purine nucleoside phosphorylase  42.86 
 
 
278 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06960  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  45.87 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1936  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  42.34 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1075  purine nucleoside phosphorylase  45.61 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1180  purine nucleoside phosphorylase  41.2 
 
 
269 aa  192  3e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001956  purine nucleoside phosphorylase  40.46 
 
 
274 aa  192  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3448  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  39.92 
 
 
277 aa  192  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1259  purine nucleoside phosphorylase  43.88 
 
 
264 aa  191  8e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0663  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  45.02 
 
 
282 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0601397  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0373  purine nucleoside phosphorylase  42.53 
 
 
278 aa  191  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0386  purine nucleoside phosphorylase  43.67 
 
 
272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.867141  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0606  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  41.7 
 
 
274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1022  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  43.46 
 
 
276 aa  189  5e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0711596  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1718  purine nucleoside phosphorylase  40.48 
 
 
277 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3055  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  43.75 
 
 
280 aa  187  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.089752  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0320  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  43.75 
 
 
278 aa  187  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3227  purine nucleoside phosphorylase  41.34 
 
 
275 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1196  purine nucleoside phosphorylase  43.04 
 
 
265 aa  186  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0130681  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3075  purine nucleoside phosphorylase  40.94 
 
 
275 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1292  purine nucleoside phosphorylase  40.94 
 
 
275 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.64922 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1995  purine nucleoside phosphorylase  41.43 
 
 
274 aa  186  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  decreased coverage  0.000000235429 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1011  purine nucleoside phosphorylase  40.87 
 
 
274 aa  186  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08880  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  43.22 
 
 
284 aa  185  6e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00712876  normal  0.676601 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1537  purine nucleoside phosphorylase  41.29 
 
 
276 aa  185  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.278191  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0630  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  40.68 
 
 
273 aa  185  7e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3084  purine nucleoside phosphorylase  40.55 
 
 
275 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1163  purine nucleoside phosphorylase  44.4 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1526  purine nucleoside phosphorylase  42.15 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2264  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  40.91 
 
 
275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0652  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  43.04 
 
 
282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2032  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  39.52 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0652  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  43.04 
 
 
282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0762  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  45.69 
 
 
272 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.831792  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0760  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  40.65 
 
 
272 aa  181  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0618  inosine, guanosine, xanthosine phosphorylase  41.02 
 
 
282 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0646  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  37.55 
 
 
271 aa  179  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0264  purine nucleoside phosphorylase  37.8 
 
 
267 aa  179  5.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2166  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  43.24 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.342229  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06490  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific (AFU_orthologue; AFUA_6G05320)  44.44 
 
 
315 aa  173  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000000176508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6601  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  38.71 
 
 
273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326925  normal  0.558296 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1703  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  39.2 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.423097  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2216  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  41.59 
 
 
275 aa  172  6.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>