296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2216 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2216  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  100 
 
 
275 aa  558  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1782  purine nucleoside phosphorylase  53.48 
 
 
273 aa  315  6e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.559182  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1804  purine nucleoside phosphorylase  53.53 
 
 
273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1351  purine nucleoside phosphorylase  52.01 
 
 
273 aa  310  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0477  purine nucleoside phosphorylase  52.04 
 
 
302 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0702  purine nucleoside phosphorylase  51.3 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1661  purine nucleoside phosphorylase  51.85 
 
 
273 aa  301  5.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3943  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  55.22 
 
 
271 aa  300  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.473265 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2166  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  58.09 
 
 
289 aa  298  4e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.342229  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2072  purine nucleoside phosphorylase  50.92 
 
 
273 aa  295  6e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0646  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  51 
 
 
271 aa  287  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6601  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  50.92 
 
 
273 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326925  normal  0.558296 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0369  purine nucleoside phosphorylase  51.48 
 
 
275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0373  purine nucleoside phosphorylase  51.65 
 
 
278 aa  285  5.999999999999999e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4155  purine nucleoside phosphorylase  49.62 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.127782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4110  purine nucleoside phosphorylase  49.62 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.82826e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3996  purine nucleoside phosphorylase  49.62 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.687151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3843  purine nucleoside phosphorylase  49.62 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4308  purine nucleoside phosphorylase  49.62 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0248075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4219  purine nucleoside phosphorylase  49.62 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000140945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4196  purine nucleoside phosphorylase  49.62 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00267818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1041  purine nucleoside phosphorylase  49.62 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00686248  hitchhiker  0.0000807252 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3827  purine nucleoside phosphorylase  49.62 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3917  purine nucleoside phosphorylase  49.62 
 
 
273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255669  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2785  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
273 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000440392  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1088  purine nucleoside phosphorylase  50.37 
 
 
278 aa  281  9e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1032  purine nucleoside phosphorylase  50.37 
 
 
299 aa  281  1e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0852  purine nucleoside phosphorylase  48.72 
 
 
273 aa  277  1e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2962  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  50.55 
 
 
273 aa  276  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2255  purine nucleoside phosphorylase  50.37 
 
 
280 aa  275  5e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3448  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  47.62 
 
 
277 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7245  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  50.93 
 
 
270 aa  267  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.236981  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2818  purine nucleoside phosphorylase  46.49 
 
 
272 aa  262  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1666  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  48.11 
 
 
271 aa  258  9e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.0366177 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1371  purine nucleoside phosphorylase  44.15 
 
 
275 aa  257  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.584924  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1011  purine nucleoside phosphorylase  50.2 
 
 
274 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0821  purine nucleoside phosphorylase  48.81 
 
 
281 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834093 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2264  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  46.77 
 
 
275 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06960  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  50.19 
 
 
270 aa  250  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1537  purine nucleoside phosphorylase  49.19 
 
 
276 aa  248  9e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.278191  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0777  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  44.73 
 
 
275 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2504  purine nucleoside phosphorylase  46.86 
 
 
272 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138401  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6092  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  45.74 
 
 
275 aa  245  6e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0606  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  42.49 
 
 
274 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1299  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  46.74 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05020  purine nucleoside phosphorylase  44.44 
 
 
270 aa  244  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345167  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1655  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  45.29 
 
 
288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441226  hitchhiker  0.00385339 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1783  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  41.33 
 
 
272 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0762  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  45.79 
 
 
272 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.831792  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1936  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  45.14 
 
 
275 aa  240  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1201  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  40.37 
 
 
275 aa  238  5e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.202694  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0461  purine nucleoside phosphorylase  46.12 
 
 
303 aa  237  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0558  purine nucleoside phosphorylase  47.92 
 
 
273 aa  236  3e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3055  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  45.45 
 
 
280 aa  235  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.089752  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1075  purine nucleoside phosphorylase  48.02 
 
 
269 aa  233  3e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0320  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  42.49 
 
 
278 aa  232  5e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1703  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  42.86 
 
 
273 aa  232  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.423097  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1180  purine nucleoside phosphorylase  50.63 
 
 
269 aa  231  7.000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0663  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  45.26 
 
 
282 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0601397  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0386  purine nucleoside phosphorylase  46.12 
 
 
272 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.867141  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0760  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  45.06 
 
 
272 aa  229  4e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1772  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  41.57 
 
 
272 aa  229  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0652  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  45.09 
 
 
282 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1022  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  42.59 
 
 
276 aa  228  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0711596  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0618  inosine, guanosine, xanthosine phosphorylase  44 
 
 
282 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0652  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  44.36 
 
 
282 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1196  purine nucleoside phosphorylase  47.66 
 
 
265 aa  223  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0130681  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06490  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific (AFU_orthologue; AFUA_6G05320)  50.88 
 
 
315 aa  221  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000000176508 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2032  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  43.48 
 
 
286 aa  219  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2824  purine nucleoside phosphorylase  43.49 
 
 
287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2911  purine nucleoside phosphorylase  43.49 
 
 
287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1259  purine nucleoside phosphorylase  47.21 
 
 
264 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2710  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  43.91 
 
 
281 aa  218  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00787639  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001956  purine nucleoside phosphorylase  44.44 
 
 
274 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1526  purine nucleoside phosphorylase  42.7 
 
 
265 aa  216  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2615  purine nucleoside phosphorylase  45.04 
 
 
277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0664  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  43.91 
 
 
279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693658  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2657  purine nucleoside phosphorylase  45.45 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.037583  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1995  purine nucleoside phosphorylase  46.55 
 
 
274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  decreased coverage  0.000000235429 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2787  purine nucleoside phosphorylase  45.04 
 
 
277 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245925  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2681  purine nucleoside phosphorylase  45.04 
 
 
277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2566  purine nucleoside phosphorylase  45.04 
 
 
277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000084097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4255  purine nucleoside phosphorylase  44.58 
 
 
285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1255  xanthosine phosphorylase  43.31 
 
 
277 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00111174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2561  purine nucleoside phosphorylase  43.31 
 
 
277 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0152176  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2934  purine nucleoside phosphorylase  44.75 
 
 
274 aa  208  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  0.104404 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0264  purine nucleoside phosphorylase  38.2 
 
 
267 aa  208  9e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1889  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  41.5 
 
 
277 aa  207  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000110705 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1292  purine nucleoside phosphorylase  45.16 
 
 
275 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.64922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3227  purine nucleoside phosphorylase  45.16 
 
 
275 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1119  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  43.75 
 
 
278 aa  207  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0150065  normal  0.547692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1163  purine nucleoside phosphorylase  50.75 
 
 
287 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1718  purine nucleoside phosphorylase  44.35 
 
 
277 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3075  purine nucleoside phosphorylase  44.76 
 
 
275 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3084  purine nucleoside phosphorylase  44.35 
 
 
275 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0573  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  40.68 
 
 
270 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1607  purine nucleoside phosphorylase  40 
 
 
279 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1389  purine nucleoside phosphorylase  40 
 
 
279 aa  198  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0630  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  36.86 
 
 
273 aa  195  6e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0150  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  39.78 
 
 
279 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>