48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3032 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3032  DoxX family protein  100 
 
 
153 aa  295  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.303154  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2898  DoxX  38.35 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0467  DoxX family protein  30.3 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123633  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0512  DoxX family protein  30.83 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  29.32 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  30 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  30.08 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  28.97 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  33.08 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  30.77 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  28.97 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  30.4 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  30.37 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2048  DoxX family protein  34.48 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000018933  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  26.92 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  30.23 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  26.81 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  27.13 
 
 
136 aa  43.9  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  26.92 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4935  DoxX family protein  27.97 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319097 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  30 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  30 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  30 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  30.11 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  30.11 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  29.63 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  33.08 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  27.27 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  34.48 
 
 
198 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  27.27 
 
 
143 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  31.82 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  25.17 
 
 
145 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  30 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  31.72 
 
 
133 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  34.48 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  29.46 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  30.11 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  32.93 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  32.93 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  32.93 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  28.79 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  34.44 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  35.23 
 
 
164 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  27.91 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  35.29 
 
 
164 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  24.82 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  23.74 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  29.6 
 
 
181 aa  40.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>