46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3548 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3548  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4880  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  34.69 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3740  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.85 
 
 		 150 aa  70.1  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1820  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6269  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.29 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341844  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_004310  BR1372  hypothetical protein  27.14 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.823726  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1328  hypothetical protein  26.43 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0864  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.7 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2284  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145472  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1545  hypothetical protein  34.03 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0980761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1100  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.33 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.238295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4928  hypothetical protein  30.94 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.52831  normal  0.121155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1083  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00152048  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1111  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.33 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0471  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.14 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0514663  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  34.34 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468979  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.21 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2995  hypothetical protein  31.03 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0353  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  32.22 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.934539  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.19 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1885  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.11 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00315064 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2461  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  29.5 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58294  normal  0.546385 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  35.62 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0066  hypothetical protein  28.4 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.905175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0372  hypothetical protein  32.93 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.29 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1183  hypothetical protein  31.63 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04380  predicted flavin-nucleotide-binding protein  31.46 
 
 		 174 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1184  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  35.48 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.230924  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0982  hypothetical protein  33.75 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1002  hypothetical protein  31.31 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45242  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0384  hypothetical protein  31.71 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0163229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0393  hypothetical protein  31.71 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.831448  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5621  hypothetical protein  27.78 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2085  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.84 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000125188 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  33.7 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  33.77 
 
 		 176 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0412  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.89 
 
 		 158 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0738895  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1137  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.89 
 
 		 158 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.329696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0873  hypothetical protein  30.49 
 
 		 146 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1794  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.89 
 
 		 158 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.109434  unclonable  0.00000000507783 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2086  hypothetical protein  29.63 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.58745 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1227  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.33 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0424349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2326  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.71 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1429  hypothetical protein  30.86 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0289  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  27.27 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>