22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2259 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2259  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  616  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300897  normal  0.797835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1295  hypothetical protein  43.3 
 
 
281 aa  226  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1693  hypothetical protein  39.49 
 
 
285 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00150047  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1391  hypothetical protein  39.49 
 
 
285 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4188  hypothetical protein  43.48 
 
 
283 aa  202  8e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2448  hypothetical protein  37.5 
 
 
319 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0274  hypothetical protein  36.86 
 
 
328 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.491507  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2252  hypothetical protein  38.76 
 
 
296 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0273  hypothetical protein  35.27 
 
 
336 aa  185  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.747748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4189  hypothetical protein  38.35 
 
 
300 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1098  hypothetical protein  37.14 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.193091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1265  hypothetical protein  38.78 
 
 
298 aa  162  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486985  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4200  hypothetical protein  30.88 
 
 
295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104599  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4156  hypothetical protein  31.11 
 
 
283 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.520818  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4610  hypothetical protein  35.15 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1946  hypothetical protein  31.53 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.880303  normal  0.0467716 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10293  conserved hypothetical protein  32.5 
 
 
453 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4515  hypothetical protein  30.47 
 
 
283 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.150515  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01187  conserved hypothetical protein  30.56 
 
 
444 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4207  hypothetical protein  27.78 
 
 
280 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01835  hypothetical protein  26.37 
 
 
428 aa  85.1  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0088  hypothetical protein  26.42 
 
 
217 aa  49.3  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>